Acidiplasma

Gattung von Archaeen From Wikipedia, the free encyclopedia

Acidiplasma ist eine Gattung von Archaeen, die zusammen mit der Gattung Ferroplasma zur Anfang der 2000er Jahre erstmals be­schrie­benen Familie Ferroplasmaceae gehört.[2][3][4]

Schnelle Fakten Systematik, Wissenschaftlicher Name ...
Acidiplasma
Systematik
Reich: Methanobacteriati
Abteilung: Methanobacteriota/Thermoplasmatota
Klasse: Thermoplasmata
Ordnung: Thermoplasmatales
Familie: Ferroplasmaceae
Gattung: Acidiplasma
Wissenschaftlicher Name
Acidiplasma
Golyshina et al. 2009[1]
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Beschreibung und Forschungsgeschichte

Forschungsgeschichte

Acidiplasma cupricumulans wurde im Jahr 2006 aus einer Sicker­lösung isoliert, die in der Bergbaustätte der Myanmar Ivanhoe Copper Company (MICCL) in Myanmar entnommen worden war. Die Spezies wurde zunächst als Ferroplasma cupricumulans bzw. Ferroplasma cyprexacervatum beschrieben, d. h. als Mitglied der Schwestergattung Ferroplasma innerhalb der gemeinsamen Familie Ferroplasmaceae. Es handelte sich dabei um das erste leicht thermophile Mitglied dieser Gruppe; Referenzstamm ist BH2.[5][6][7]

Im Jahr 2009 wurde dann Acidiplasma als eine neue Gattung von acidophilen und thermophilen Archaeen charakterisiert, mit A. aeolicum als Typusspezies und Referenzstamm Vᵀ, erstmals isoliert aus einem hydrothermalen Pool auf der Insel Vulcano, Italien. Aufgrund der Ähnlichkeit der 16S-rRNA und der DNA-DNA-Hybridisierung wurde vorgeschlagen, die bisherige Spezies Ferroplasma cupricumulans in diese neue Gattung Acidiplasma überzuführen und in Acidiplasma cupricumulans umzubenennen.[1][7]

Beschreibung

Die Morphologie (Gestalt) der Zellen von A. aeolicum Vᵀ (Referenzstamm der Typusart) variiert von pleomorph bis kokkoid. Der Temperaturbereich für das Wachstum des Stammes liegt zwischen 15 und 65 °C (Optimum bei 45 °C); der pH-Wert für das Wachstum reicht von pH 0 bis 4 (Optimum bei pH 1,4–1,6). Dieser Stamm ist in der Lage, sowohl aerob als auch anaerob zu wachsen, wobei er Eisen(II) oxidiert respektive Eisen(III) reduziert. Das Isolat Vᵀ wuchs chemo-organotroph mit Hefe­extrakt (sowohl mit als auch ohne zusätzliche Glukose) als Energie- und Kohlenstoffquelle. Der G+C-Gehalt in der DNA beträgt 36 mol%. Die Analyse der 16S-rRNA-Gensequenz zeigte, dass der Stamm zur Familie der Ferroplasmaceae in der Ordnung Thermoplasmatales gehört.[1]

Systematik

Die hier angegebene Taxonomie basiert mit Stand 24. Februar 2022 auf den folgenden Quellen:

Familie Ferroplasmaceae Golyshina et al. 2000[10](L,N) [Ferroplasmataceae(N)] – in der GTDB jedoch Thermoplasmataceae(G)

  • Gattung Acidiplasma Golyshina et al. 2009(L,N,G)[1]
    • Spezies Acidiplasma aeolicum Golyshina et al. 2009(L,N)[1][11] — Typusart(L)
      • Stamm V(B,L,N,G) alias DSM 18409 oder JCM 14615(B,L,N) — Referenzstamm (nicht in der GTDB)
      • Stamm VT(G) – Referenzstamm in der GTDB
    • Spezies Acidiplasma cupricumulans (Hawkes et al. 2008) Golyshina et al. 2009(B,L,N)[5] [Ferroplasma cupricumulans Hawkes et al. 2008(B,L,N), Ferroplasma cyprexacervatum[12]][6][1] – in der GTDB synonym mit A. aeolicum
      • Stamm BH2(B,L,N,G) alias DSM 16651 oder JCM 13668(B,L,N) — Referenzstamm; in der GTDB ist JCM 13668 ein eigener Stamm (abgetrennt))
    • Spezies Acidiplasma sp. BR-02(N) – in der GTDB synonym mit A. aeolicum
      • Stamm BR-02(N,G)
    • Spezies Acidiplasma sp. MBA-1(N) – in der GTDB synonym mit A. aeolicum
      • Stamm MBA-1(N,G)
    • Spezies Acidiplasma sp. isolate clean202(N) – in der GTDB zu/synonym mit A. aeolicum(G)
      • Stamm clean202(N,G)
    • Spezies Acidiplasma sp. isolate clean2756(N) – in der GTDB zu/synonym mit A. aeolicum(G)
      • Stamm clean2756(N,G)
    • Spezies Acidiplasma sp. isolate clean2757(N) – in der GTDB zu/synonym mit A. aeolicum(G)
      • Stamm clean2757(N,G)
    • Spezies Acidiplasma sp. isolate clean2758(N) – in der GTDB zu/synonym mit A. aeolicum(G)
      • Stamm clean2758(N,G)
    • Spezies Acidiplasma sp. isolate clean2759(N) – in der GTDB zu/synonym mit A. aeolicum(G)
      • Stamm clean2759(N,G)
    • Spezies Acidiplasma sp. isolate clean2760(N) – in der GTDB zu/synonym mit A. aeolicum(G)
      • Stamm clean2760(N,G)
    • Spezies Acidiplasma sp. isolate DRTY-19_202007_bins_3(N) – in der GTDB zu/synonym mit A. aeolicum(G)
      • Stamm DRTY-19_202007_bins_3(N,G)
    • Spezies Thermoplasmata archaeon isolate TL2-2.bin20(N) – in der GTDB zu/synonym mit A. aeolicum(G), in der NCBI-Taxonomie zu Thermoplasmata ohne nähere Zuordnung
      • Stamm TL2-2.bin20(N,G)
    • Spezies Thermoplasmata archaeon isolate TL2-4.bin14(N) – in der GTDB zu/synonym mit A. aeolicum(G), in der NCBI-Taxonomie zu Thermoplasmata ohne nähere Zuordnung
      • Stamm TL2-4.bin14(N,G)
    • Spezies Thermoplasmata archaeon isolate WH3.bin6(N) – in der GTDB zu/synonym mit A. aeolicum(G), in der NCBI-Taxonomie zu Thermoplasmata ohne nähere Zuordnung
      • Stamm WH3.bin6(N,G)
    • ?Spezies Ferroplasmaceae archaeon WS[4] [Ferroplasmataceae archaeon WS[13]]

In der GTDB werden alle bekannten Vertreter der Gattung Acidiplasma anders als in der LPSN und der NCBI-Taxonomie der Spezies A. aeolicum zugeschrieben, insbesondere ist auch die Art A. cupricumulans mit dieser synonymisiert.[9]

Etymologie

Der Gattungsname Acidiplasma leitet sich ab von neulateinisch acidum ‚Säure‘ und altgriechisch πλάσμα plasma, deutsch ‚etwas Geformtes‘, ‚Gegossenes‘; der Name bedeutet also „säurehaltige Form“.[7]

  • Das Art-Epitheton aeolicum ist ein Adjektiv und verweist auf die Äolischen Inseln, zu denen die Insel Vulcano gehört, wo der Typusstamm gefunden wurde.[7][1]
  • Das Art-Epitheton cupricumulans leitet sich ab von lat. cuprum ‚Kupfer‘ und den Adjektiv cumulans ‚anhäufend‘, bedeutet also „Kupfer anhäufend“.[7]

Siehe auch

Weblinks

Einzelnachweise

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