Geplafuvirales
Viren-Ordnung der Klasse Repensiviricetes
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Geplafuvirales ist die einzige Ordnung von Viren in der Klasse Repensiviricetes des Phylums der CRESS-DNA-Viren Cressdnaviricota.[2][1][3] Zur Ordnung gehören neben isolierten Virusstämmen auch per Metagenomik erfasste (und hinreichend vollständige) Contigs (englisch auch metagenome-assembled genomes, MAGs genannt) aus der Verwandtschaft der Familie Geminiviridae, beispielsweise die Familie Genomoviridae.
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Gereinigtes Maize streak virus (MSV), | ||||||||||||
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Die Phylogenie der CRESS-DNA-Viren zeigt (mit Stand April 2019) zwei große Kladen, von denen die erste die Familien Geminiviridae, Genomoviridae und die (bisher taxonomisch nicht erfasste) Gruppe der CRESSV6-Viren umfasst. Das International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) ist dem 2019er Vorschlag gefolgt und hat diese erste Klade als Ordnung Geplafuvirales offiziell bestätigt.[3]
Beschreibung
Wie bei allen CRESS-DNA-Viren kodiert das Genom der Geplafuvirales für ein Replikations-Initiations-Protein (Rep oder REP) und ein Kapsidprotein (Cap, CAP oder CP).
Gemeinsames und kennzeichnendes Merkmal des REP der Geplafuvirales ist das sog. GRS-Motiv (en. Geminivirus Rep Sequence), das sich zwischen den Motiven II und III befindet und in der anderen Großklade der CRESS-DNA-Viren nicht vorkommt. Dieses Motiv ermöglicht vermutlich die räumliche Anordnung der Motive II und III im REP.[4][5][3] Im Übrigen fehlt den Geminiviridae und Genomoviridae, nicht aber CRESSV6, der Argininfinger im Helikasemotiv.[3]
Etymologie
Die Namen der Klasse und Ordnung leiten sich entsprechend dem Vorschlag an das ICTV von 2019 wie folgt her:[3]
- Repensiviricetes ist ein Portmanteau (Kofferwort), zusammengesetzt aus Rep-encoding single strand und der Endung -viricetes für Virusklassen.
- Geplafuvirales ist zusammengesetzt aus ge- für Gemini-/Genomo-, pla- für Pflanzen (en. plants) und fu- für Pilze (lat. fungi), -virales ist die Endung für Virusordnungen.
Systematik
Mit Stand Juni 2024 hat die Ordnung folgende Zusammensetzung:[7][8]
Ordnung Geplafuvirales
- Familie Genomoviridae
- Familie Geplanaviridae (früher provisorisch CRESSV6-Viren, englisch CRESSV6 viruses)[3] alias „CRESS6“ (Vorschlag, mit provisorischen Namen)[9][6][10]
- Gattung Acciovirus
- Gattung Aguamentivirus
- Gattung Alohovirus
- Gattung Aparevirus
- Gattung Avadavirus
- Gattung Densaugvirus
- Gattung Diffindovirus
- Gattung Engorgivirus
- Gattung Episkevirus
- Gattung Expellivirus
- Gattung Impedivirus
- Gattung Lumovirus
- Gattung Oblivivirus
- Gattung Patrovirus
- Gattung Protegovirus
- Gattung Riddikuvirus
- Gattung Stupevirus
- Gattung Wingardivirus
