Markus Affolter

Markus Affolter studierte Biologie an der ETH Zürich sowie an der Universität Laval in Québec. Im Anschluss an seine Doktorarbeit an der Laval University ging er 1988 als Postdoktorand ans Biozentrum der Universität Basel. Im Labor von Walter Gehring begann Markus Affolter seine Forschungsarbeit mit der Fruchtfliege Drosophila melanogaster. Im Jahr 2000 wurde er Assistant Professor und 2005 Full Professor für Entwicklungsbiologie am Biozentrum der Universität Basel. Affolter wurde 2025 nach über vier Jahrzehnten Tätigkeit in Forschung und Lehre emeritiert^[2].

Markus Affolter erforscht die zellulären und molekularen Prozesse bei der Ausbildung von Organen und Blutgefässnetzwerken bei der Fruchtfliege Drosophila melanogaster sowie beim Zebrafisch. Markus Affolter gelang es, anhand von live-Imaging-Untersuchungen die Netzwerkbildung in Drosophila und im Zebrafisch mit Hilfe hochauflösender Mikroskopie live zu dokumentieren. Dies erlaubt es nun, die Funktion von Molekülen in der Morphogenese besser verstehen zu können. Weiterhin zeigte sein Labor in Zusammenarbeit mit der Universität Freiburg, Deutschland, und der Universität Lausanne, Schweiz, dass das Morphogen Dpp und der Feedback-Regler Pentagone Schlüsselfunktionen beim proportionalen Gewebewachstum (Scaling) in der Flügelscheibe der Fruchtfliege übernehmen^[3]. Neben biologischen Fragestellungen lag ein Schwerpunkt seiner Arbeit auf der Entwicklung neuer Methoden. Dazu gehören Nanobody-Tools zur Untersuchung der Funktion und Lokalisierung von Proteinen während der Entwicklung von Organismen sowie die SEED/Harvest-Methode, eine CRISPR/Cas9-basierte Technik zur effizienten Markierung von Proteinen^[4].

• 1983: K.M. Hunter Award des National Cancer Institutes of Canada^[5]
• 1999: gewähltes Mitglied der European Molecular Biology Organization (EMBO)^[6]
• 2008: gewähltes Mitglied der Nationalen Akademie der Wissenschaften Leopoldina^[7]

Vollständige Publikationsliste^[8]

• Schnider, S.T., Vigano, M.A., Affolter, M., and Aguilar, G. (2024) “Functionalized Protein Binders in Developmental Biology”, Annual Review of Cell and Developmental Biology, 40(1), pp. 119–142. Available at: 10.1146/annurev-cellbio-112122-025214.
• Bauer, M., Aguilar, G., Wharton, K.A., Matsuda, S., Affolter, M. (2023) “Heterodimerization-dependent secretion of bone morphogenetic proteins in Drosophila”, Developmental Cell, Online Ahead of Print, p. Epub. Available at: 10.1016/j.devcel.2023.03.008. edoc
• Matsuda, S., Schaefer, J.V., Mii, Y., Hori, Y., Bieli, D., Taira, M., Plückthun, A. and Affolter, M. (2021) “Asymmetric requirement of Dpp/BMP morphogen dispersal in the Drosophila wing disc”, Nature Communications, 12(1), p. 6435. Available at: 10.1038/s41467-021-26726-6. edoc | Open Access
• Harmansa, S., Hamaratoglu, F., Affolter, M., Caussinus, E. (2015) “Dpp spreading is required for medial but not for lateral wing disc growth”, Nature, 527(7578), pp. 22–317. Available at: 10.1038/nature15712. edoc
• Bürglin, T.R. and Affolter, M. (2015) “Homeodomain proteins: an update”., Chromosoma, 125(3), pp. 497–521. Available at: 10.1007/s00412-015-0543-8. edoc
• Caussinus, E., Kanca, O. and Affolter, M. (2012) “Fluorescent fusion protein knockout mediated by anti-GFP nanobody”, Nature structural & molecular biology, 19(1), pp. 21–117. Available at: 10.1038/nsmb.2180. edoc
• Herwig, L., Blum, Y., Krudewig, A., Ellertsdottir, E., Lenard, A., Belting, H.G. and Affolter, M. (2011) “Distinct cellular mechanisms of blood vessel fusion in the zebrafish embryo”, Current Biology, 21(22), pp. 8–1942. Available at: 10.1016/j.cub.2011.10.016. edoc
• Blum, Y., Belting, H.G., Ellertsdottir, E., Herwig, L., Lüders, F. and Affolter, M. (2008) “Complex cell rearrangements during intersegmental vessel sprouting and vessel fusion in the zebrafish embryo”, Developmental biology, 316(2), pp. 22–312. Available at: 10.1016/j.ydbio.2008.01.038. edoc
• Gehring, W., Qian, Y.Q., Billeter, M., Furukubo-Tokunaga, K., Schier, A.F., Resendez-Perez, D., Affolter, M., Otting, G., Wüthrich, K. (1994) “Homeodomain-DNA recognition”, Cell, 78(2), pp. 211–223. Available at: 10.1016/0092-8674(94)90292-5. edoc

• Prof. em. Dr. Markus Affolter emeriti.biozentrum.unibas.ch, abgerufen am 7. Januar 2026.

• Forscherportrait Markus Affolter
• University of Basel, Interview Prof. Dr. Markus Affolter (englisch)
• Weltenreise 3, Blutgefässbildung am Beispiel des Zebrafisches, abgerufen am 27. Dezember 2013
• Playliste auf Youtube, abgerufen am 17. September 2014