Podoviridae
familia de virus infectivos para bacterias (bacteriófagos)
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Podoviridae fue una antigua familia de virus infectivos para procariotas (bacterias y arqueas) que contenía 3 subfamilias, 52 géneros y 130 especies agrupados basado en la morfología del virion. En 2023 la familia fue abolida junto con las de otros caudovirus Myoviridae y Siphoviridae tras demostrarse que son un conjunto polifilético, por lo que actualmente el término "podovirus" se usa para referirse al morfotipo del virion de estos caudovirus.[1]
| Podoviridae | ||
|---|---|---|
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| Taxonomía | ||
| Dominio: | Duplodnaviria | |
| Orden: | Caudovirales | |
| Familia: | Podoviridae* | |
| Clasificación de Baltimore | ||
| Grupo: | I (Virus ADN bicatenario) | |
Descripción
Los viriones de los podovirus tienen cápsides con geometrías icosaédricas y cabeza-cola. No poseen envoltura vírica. El diámetro es de alrededor de 60 nm, y consta de 72 capsómeros. Las proteínas de la cabeza tiene una masa molecular de ~ 38 kiloDaltons y está presente en 460 copias por virión. Hay 9 proteínas estructurales. La cola no es contráctil y tiene 6 fibras subterminales cortas. Es grueso, tiene forma de varilla y está construido con discos apilados. La longitud máxima es de ~ 17 nm.
El genoma es lineal y de ADN bicatenario, de alrededor de 40-42 kb de longitud, y codifica ~ 55 genes. El contenido de guanina + citosina es ~ 50%. Tienen secuencias terminalmente redundantes y no están permutadas. En peso, el genoma constituye ~ 50% de los virus. El genoma codifica 9 proteínas estructurales, una ADN polimerasa de tipo transferasa B adenilada y una ARN polimerasa. Tres proteínas internas constituyen el complejo polimerasa. Se reconocen dos clases de genes (temprano y tardío). Esta clasificación se basa en el momento de la transcripción que está regulado temporalmente. Los genes con funciones relacionadas se agrupan. La replicación del genoma es bidireccional.
La replicación viral se produce en el citoplasma. La entrada en la célula huésped se logra mediante adsorción en la célula huésped. La replicación sigue el modelo de desplazamiento de la cadena de ADN. La transcripción con plantilla de ADN es el método de transcripción. El virus sale de la célula huésped por lisis y proteínas holina/endolisina/spanina. Las bacterias y arqueas sirven como huéspedes naturales. Las rutas de transmisión son por difusión pasiva.
Se considera que HTVC010P, bacteriófago de Pelagibacter ubique, es el organismo más abundante de la Tierra.[2]
Taxonomía
Se había descrito las siguientes subfamilias y géneros:
- Picovirinae
- Capunavirus
- Negarvirus
- Salasvirus
- Rakietenvirinae
- Andhravirus
- Rosenblumvirus
- Sepvirinae
- Diegovirus
- Oslovirus
- Traversvirus
Los siguientes géneros no habían sido asignados a una subfamilia:
- Anjalivirus
- Astrithrvirus
- Badaztecvirus
- Baltimorevirus
- Bjornvirus
- Bruynoghevirus
- Burrovirus
- Chopinvirus
- Cimandefvirus
- Delislevirus
- Dybvigvirus
- Enhodamvirus
- Fipvunavirus
- Firingavirus
- Gervaisevirus
- Giessenvirus
- Hollowayvirus
- Jasminevirus
- Kafunavirus
- Kelquatrovirus
- Kochitakasuvirus
- Kozyakovvirus
- Krylovvirus
- Kuravirus
- Lahexavirus
- Lastavirus
- Lederbergvirus
- Lessievirus
- Lightbulbvirus
- Myxoctovirus
- Pagevirus
- Parlovirus
- Perisivirus
- Privateervirus
- Rauchvirus
- Ryyoungvirus
- Schmidvirus
- Sendosyvirus
- Skarprettervirus
- Sortsnevirus
- Uetakevirus
- Vicosavirus
- Wumpquatrovirus
- Wumptrevirus
- Xuquatrovirus
