Polimerasa
enzima capaz de transcribir o duplicar ácidos nucleicos
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La polimerasa es una enzima capaz de transcribir o replicar ácidos nucleicos, que resultan cruciales en la división celular (ADN polimerasa) y en la transcripción del ADN (ARN polimerasa).[1] La ADN polimerasa y la ARN polimerasa se utilizan para ensamblar moléculas de ADN y ARN, respectivamente, copiando una hebra de plantilla de ADN usando interacciones de emparejamiento de bases o ARN mediante replicación de media escalera.
externos
ExPASy: NiceZime view
KEGG: entrada en KEEG
PRIAM: perfil PRIAM
ExplorEnz: entrada en ExplorEnz
MetaCyc: vía metabólica
| Polimerasa | ||||
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| Estructuras disponibles | ||||
| PDB | ||||
| Identificadores | ||||
| Identificadores externos |
ExPASy: NiceZime view KEGG: entrada en KEEG PRIAM: perfil PRIAM ExplorEnz: entrada en ExplorEnz MetaCyc: vía metabólica | |||
| Número EC | 2.7.7 | |||
| Estructura/Función proteica | ||||
| Tipo de proteína | Transferasa | |||
| Funciones | Enzima | |||
| Ortólogos | ||||
| Especies |
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| Ubicación (UCSC) |
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| PubMed (Búsqueda) |
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| PMC (Búsqueda) |
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| Polimerasa | ||
|---|---|---|
 Estructura tridimensional de la ADN polimerasa | ||
| Identificadores | ||
La ADN polimerasa es la enzima que lleva a cabo la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), una técnica que ha desempeñado un papel esencial en el desarrollo de la genética.
Una polimerasa puede depender de la plantilla o ser independiente de la plantilla. La poli(A)-ARN-Polimerasa (PAP) es un ejemplo de polimerasa independiente de la plantilla. También se sabe que la terminal desoxirribonucleotidil transferasa (TdT) tiene actividades independientes del molde y dependientes del molde.
Diferenciación
| Tipo | Abreviatura | Plantilla → Producto | Función |
|---|---|---|---|
| ADN-dependiente ADN polimerasa | DDDP | ADN → ADN | Replicación |
| ARN-dependiente ADN polimerasa | RDDP | ARN → ADN | Transcripción inversa |
| ADN-dependiente ARN polimerasa | DDRP | ADN → ARN | Transcripción |
| ARN-dependiente ARN polimerasa | RDRP | ARN → ARN | Replicación de los Virus ARN |
| independiente ARN polimerasa | → ARN | ||
| independiente ADN polimerasa | → ADN |
Clasificación
- ADN-dependiente ADN polimerasa (DDDP)
- Familia A: Incluye las ADN polimerasas eucariotas γ, θ, ν y la procariota I.
- Familia B: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ζ, α, δ, ε y la procariota II. También se ha propuesto la inclusión de algunas ADN polimerasas virales.
- Familia D: Incluye la ADN polimerasa procariota D y también se ha propuesto la inclusión de algunas ADN polimerasas virales.
- Familia X: Incluye las ADN polimerasas eucariotas β, σ, λ, μ, TDT y la procariota III.
- Familia Y: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ι, κ, η y las procariotas IV y V.
- ADN-dependiente ARN polimerasa (DDRP)
- ARN-dependiente ADN polimerasa (RDDP)
- ARN-dependiente ARN polimerasa (RDRP)
- RdRP viral
- cRdRP eucariota (en algunos eucariotas infectados por virus de ARN)
- Elongación de ARN sin plantilla
- PAP, PNPase
Demostración
Por estructura
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Las polimerasas generalmente se dividen en dos superfamilias, con pliegue de "mano derecha" y pliegue de "barril beta doble psi" (a menudo simplemente "doble barril"). El primero se ve en casi todas las ADN polimerasas y casi todas las polimerasas virales de subunidad única; están marcados por un dominio de "palma" conservado. Este último se observa en todas las ARN polimerasas de múltiples subunidades, en la cRdRP y en las ADN polimerasas de la "familia D" que se encuentran en las arqueas. La familia "X" representada por la ADN polimerasa beta tiene solo una forma vaga de "palma" y, a veces, se considera una superfamilia diferente.
Las primas generalmente no entran en ninguna categoría. Por ejemplo las primasas bacterianas suelen tener el dominio Toprim y están relacionadas con las topoisomerasas y la helicasa centelleo mitocondrial. Las primasas eucariotas y arqueanas forman una familia AEP no relacionada, posiblemente relacionada con la polimerasa palma. Sin embargo, ambas familias se asocian al mismo conjunto de helicasas.
