Isomorphic Labs

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Isomorphic Labs
Histoire
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Isomorphic Labs est une filiale d'Alphabet créée par Google à Londres en 2021, afin d'utiliser l'intelligence artificielle pour créer de nouveaux médicaments in silico, via un moteur de conception de médicaments par IA. Cette entreprise est surtout connue pour avoir créé AlfaFold en 2024, puis IsoDDE (Isomorphic Labs Drug Design Engine) en 2026.

Son fondateur et PDG est l'entrepreneur anglais Demis Hassabis, qui dirige également Google DeepMind (autre filiale d'Alphabet). En 2026, son Président est Max Jaderberg ; et plus de 300 employés travaillent dans l'entreprise (ingénieurs, scientifiques…), à Londres, Lausanne et Cambridge.

Isomorphic Labs a été constituée en , mais annoncée publiquement en [1]. Selon la start-up, son nom (Isomorphic) fait référence à l'idée qu'il semble exister dans l'univers une symétrie — sous-jacente — entre la biologie et la science de l’information.

Un an plus tard (), Isomorphic Labs a annoncé l'ouverture d'un deuxième établissement à Lausanne, en Suisse[2].

En , la stard-Up s'est associée à Novartis et Eli Lilly and Company, puis avec Johnson & Johnson pour collaborer à la recherche et la découverte de médicaments à l'aide de l'intelligence artificielle[3],[4].

En , Google DeepMind et Isomorphic Labs ont annoncé la sortie d'AlphaFold 3, une plateforme informatique unifiée, dédiée à la conception de médicament, librement disponible pour la recherche non commerciale. AlphaFold 3 est un système d'IA qui ne se limite pas à prédire comment les protéines se replient ; elle peut aussi prédire les interactions entre protéines, et entre protéines avec des molécules typiquement à la base de médicaments telles que les ligands ou les anticorps, ce qui devrait accélérer la protéomique et la découverte de médicaments.
À cette occasion, Isomorphic Labs annonce utiliser déjà AlphaFold 3 ainsi que d'autres modèles d'IA complémentaires pour la recherche de nouveaux médicaments[5].

En , Isomorphic Labs Drug Design Engine (IsoDDE) est présenté aux médias, comme un outil « qui identifie en quelques secondes des sites d’amarrage jusqu'alors inconnus sur des protéines, avec une précision de qualité laboratoire, tout en estimant la solidité de la liaison à une fraction du coût traditionnel »[6]. Cet outil fait suite à AlphaFold 3, avec des performances très améliorées[7],[6],[8] :

  • doublement (selon le benchmark « Runs N' Poses ») de la précision d'AlphaFold 3 (AF3) en termes de prédiction des structures protéine‑ligand ;
  • identification de nouvelles poches cachées (dites cryptiques, qui sont des sites de liaison « cachées » dans la structure non liée d’une protéine, mais qui apparaissent après un changement de configuration structurale de la protéine, changement souvent induit par un ligand) ;
  • amélioration de 2,3 fois de la précision par rapport à AlphaFold 3 et amélioration de 19,8 fois par rapport à Boltz-2 dans la prédiction des structures anticorps-antigène (Boltz‑2 est un modèle open‑source d'IA dédiée au domaine biomoléculaire, créé par des chercheurs du MIT et de l'entreprise Recursion, présenté comme la seconde génération de la famille Boltz, publié sur GitHub) ;
  • estimation très améliorée des affinités de liaison (Binding Affinity, la mesure de la force avec laquelle un médicament se lie à sa cible).

… tout en réduisant considérablement les coûts de recherche et découverte, ce qui pourrait permettre aux chercheurs en biotechnologies de classer rapidement des milliers de candidats médicaments potentiels in silico avant de s'engager dans une synthèse coûteuse en laboratoire humide, avec le risque que l'outil soit détourné pour produire des armes chimiques ou des drogues. Début 2026, l'outil est déjà utilisé en interne pour piloter le pipeline des candidats-médicaments d'Isomorphic Labs.

Le PDG a indiqué que l'entreprise prévoit que ses premiers médicaments conçus par IA entreront en essais cliniques d'ici la fin de 2026. Ce calendrier suggère une transition rapide du prototypage numérique à l'application humaine, un rythme inimaginable il y a dix ans.
IsoDDE est conçu pour généraliser au‑delà des données d'entraînement (ce qui signifie qu'IsoDDE peut prédire correctement la structure et le comportement de couples protéine‑ligand qu'il n'a jamais vus auparavant, même quand ils sont très différents de ceux utilisés pour entraîner le modèle, alors que son prédécesseur, AlphaFold 3, voyait sa précision diminuer face à des structures biochimiques inédites. Isomorphic Labs estime que cette capacité à mieux modéliser les interactions biomoléculaires nouvelles ouvre la voie à une exploration plus efficace de l'espace biochimique et à une conception rationnelle, accélérée et moins couteuse de molécules thérapeutiques.

Financements

Isomorphic Labs a été créé comme émanation commerciale des avancées de DeepMind dans le domaine des biotechnologies et de la biochimie.

En , l’entreprise a réalisé son premier tour de financement institutionnel, levant 600 millions de dollars — soit environ 579 millions selon les estimations de PitchBook — auprès d’Alphabet, de Google Ventures (GV) et du fonds Thrive Capital[9].

Gouvernance

Le , Max Jaderberg (Chercheur[10], ancien de DeepMind et antérieurement « Directeur de l'IA » chez Isomorphic Labs) remplace en tant que président Colin Murdoch[11].

Enjeux éthiques et de biosécurité

Références

Voir aussi

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