Theiavirus salishense

Les particules virales (virions) de T. salishense ressemblent à celles des Mimivirus et, comme eux, possèdent une structure en étoile sur la capside. Leur diamètre est d'environ 300 nm. Les virions se répliquent dans des usines virales cytoplasmiques typiques des Mimiviridae^[5].

Le génome du BsV est linéaire et constitué d'ADN double brin (ADNdb). Il mesure 1 385 869 pb (paires de bases). La teneur en paires GC est de 25,3 %. Selon les études, le génome serait composé de 1 227 cadres de lecture ouverts (ORF) et coderait 1 207 protéines. Une homologie avec des séquences eucaryotes connues a été constatée pour 27 % de ces protéines codées, tandis qu'aucune similitude n'est identifiable pour plus de la moitié d'entre elles. Les protéines codées sont impliquées dans la réplication et la réparation de l'ADN, ainsi que dans la synthèse et la modification de l'ARN. Il existe également des protéines de traduction et des protéines de capside^[5],[3],[6].

Contrairement à d'autres virus géants connus, le BsV ne possède pas de gènes codant d'ARNt. Comme il ne code pas d'enzymes impliquées dans la synthèse des protéines, il doit utiliser les ARNt de l'hôte à cette fin^[5],[3].

Les gènes impliqués dans le système de fusion membranaire pourraient provenir de l'hôte eucaryote par transfert horizontal de gènes. Ils permettraient aux virions de pénétrer dans la cellule hôte.

Des éléments génétiques mobiles sont présents en grand nombre, notamment des protéines d'autoépissage (appelées intéines) et des séquences agissant comme des ribozymes capables de se détacher de l'ARN. De tels éléments génétiques mobiles n'avaient jamais été découverts auparavant chez d'autres virus géants^[5],[3].

148 copies d'une protéine potentiellement impliquée dans la lutte contre les défenses de l'hôte sont présentes. Selon les auteurs, ce gène a été dupliqué à plusieurs reprises car une plus grande quantité était nécessaire pour que le virus se réplique efficacement dans les cellules hôtes. Une duplication similaire des gènes codant un antagoniste d'une protéine immunitaire de l'hôte a également été observée dans le génome du virus de la vaccine (Poxviridae).

La souche Bodo saltans (en) a été isolée par Deeg et al. en 2014 à partir d'un échantillon d'eau prélevé près de la surface sédimentaire de l'étang (eutrophe) du Nitobe Memorial Garden (NG), sur le terrain de l'Université de la Colombie-Britannique, à l'ouest de Vancouver, au Canada. Des concentrés viraux ont été collectés dans 11 sites d'eau douce du sud de la Colombie-Britannique. Des cultures de Bodo saltans NG ont été inoculées avec le concentré viral (à environ 2 × 10⁵ cellules/mL) issu de l'ensemble des 11 sites^[5],[7].

La souche BsV NG1 (BsV-NG1) infecte la souche Bodo saltans (en) NG (CCCM6296), mais pas HFCC12^[5].

Le nom de genre « Theiavirus » est construit sur Theia, l'un des douze Titans de la mythologie grecque^[1]. L'épithète spécifique « salishense » est une forme latinisée, d'après les Salish de la côte, un groupe autochtone habitant près de la mer des Salish (la zone maritime située entre l'île de Vancouver et l'État américain de Washington) où a été réalisé le prélèvement.

Les plus proches parents de T. salishense sont les virus révélés par métagénomique à Klosterneuburg : Klosneuvirus (KnV ou KlosnV), Hokovirus (HokV), Catovirus (CatV) et Indivirus (IndV). Ensemble, ils appartiennent à la sous-famille des Klosneuvirinae, famille des Mimiviridae, confirmée par l'ICTV^[8]. La plupart des Klosneuvirinae sont plus proches des Mimivirus que de « Rheavirus sinusmexicani » (sous-famille des « Aliimimivirinae »)^[5].

Disa Bäckström et al. (2019), figure 3, ont établi une phylogénie des Klosneuvirinae selon laquelle Catovirus est le plus proche parent de T. salishense parmi les quatre Klosneuvirus originaux^[9]. D'autres cladogrammes des Klosneuvirus sont disponibles sous Klosneuvirus §Systematics.