GRIK1

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GRIK1GluK1もしくはGluR5(glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1)は、ヒトではGRIK1遺伝子にコードされるタンパク質である[5]

PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
記号GRIK1, EAA3, EEA3, GLR5, GLUR5, GluK1, gluR-5, glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1
概要 PDBに登録されている構造, PDB ...
GRIK1
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

2ZNS, 2ZNT, 2ZNU, 3FUZ, 3FV1, 3FV2, 3FVG, 3FVK, 3FVN, 3FVO, 4MF3

識別子
記号GRIK1, EAA3, EEA3, GLR5, GLUR5, GluK1, gluR-5, glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1
外部IDOMIM: 138245 MGI: 95814 HomoloGene: 68992 GeneCards: GRIK1
遺伝子の位置 (ヒト)
21番染色体 (ヒト)
染色体21番染色体 (ヒト)[1]
21番染色体 (ヒト)
GRIK1遺伝子の位置
GRIK1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点29,536,933 bp[1]
終点29,940,033 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
16番染色体 (マウス)
染色体16番染色体 (マウス)[2]
16番染色体 (マウス)
GRIK1遺伝子の位置
GRIK1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点87,692,788 bp[2]
終点88,087,153 bp[2]
RNA発現パターン


さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 イオンチャネル活性
kainate selective glutamate receptor activity
extracellularly glutamate-gated ion channel activity
ionotropic glutamate receptor activity
ligand-gated ion channel activity
シグナル伝達受容体活性
glutamate receptor activity
transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential
細胞の構成要素 integral component of membrane
細胞結合
細胞膜
postsynaptic membrane
integral component of plasma membrane
シナプス

kainate selective glutamate receptor complex
presynaptic membrane
生物学的プロセス glutamate receptor signaling pathway
中枢神経系発生
イオン経膜輸送
regulation of synaptic transmission, glutamatergic
イオン輸送
神経系発生
化学的シナプス伝達
ionotropic glutamate receptor signaling pathway
興奮性シナプス後電位
synaptic transmission, glutamatergic
シナプス伝達の制御
regulation of postsynaptic membrane potential
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)
NM_000830
NM_175611
NM_001320616
NM_001320618
NM_001320621

NM_001320630
NM_001330993
NM_001330994
NM_001393424
NM_001393425
NM_001393426

NM_010348
NM_146072
NM_001346964

RefSeq
(タンパク質)
NP_000821
NP_001307545
NP_001307547
NP_001307550
NP_001307559

NP_001317922
NP_001317923
NP_783300

n/a

場所
(UCSC)
Chr 21: 29.54 – 29.94 MbChr 21: 87.69 – 88.09 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス
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機能

GRIK1遺伝子は、リガンド依存性イオンチャネルとして機能するグルタミン酸受容体のサブユニットの1つをコードする。この遺伝子にコードされるサブユニットは、カイニン酸受容体に属する。受容体の組み立てと細胞内の輸送は、RNA編集選択的スプライシングによって調節されている。これらの受容体は興奮性神経伝達を媒介し、シナプスの正常な機能に重要である[5]

相互作用

GRIK1はDLG4英語版[6]PICK1英語版[6]SDCBP英語版[6]と相互作用することが示されている。

RNA編集

GluK1をコードするpre-mRNAは、膜貫通領域M2に位置するQ/R部位の1か所が編集される。編集によって、この部位のコドンはグルタミン(Q)をコードするCAGからアルギニン(R)をコードするCGGへ変化する[7]GluK2と同様、編集の際に二本鎖RNAを形成する相補性配列(Editing Complementary Sequence、ECS)は編集部位から約2000ヌクレオチド下流に位置している[8]

このRNA編集は受容体のカルシウムイオン透過性に影響を与え、編集によって透過性が低下すると考えられている[7]。またQ/R部位の編集は、アラキドン酸ドコサヘキサエン酸などの膜脂肪酸によるチャネルの阻害にも影響を及ぼす[9]。編集型アイソフォームのみからなるカイニン酸受容体はこれらの脂肪酸によって強力に阻害されるが、未編集型のサブユニットが1つでも組み込まれるとこの阻害は解除される[9]

出典

関連文献

関連項目

外部リンク

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