PABPC1

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PABPC1(poly(A) binding protein cytoplasmic 1)もしくはPABP1は、ヒトではPABPC1遺伝子にコードされるタンパク質である[5]。PABPC1はmRNAに結合し、内外への輸送、分解、翻訳、安定性などさまざまな機能を促進する。ポリ(A)結合タンパク質には主に核内に位置するもの(PABPN1英語版)と細胞質に位置するもの(PABPC、単にPABPと呼ぶときにはこちらを指すことが多い)が存在し、PABPC1は後者に属する。PABPC1はその位置によって、役割やRNAとの機能が変化する[6]

PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
記号PABPC1, PAB1, PABP, PABP1, PABPC2, PABPL1, poly(A) binding protein cytoplasmic 1
染色体8番染色体 (ヒト)[1]
概要 PDBに登録されている構造, PDB ...
PABPC1
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

1CVJ, 1G9L, 1JGN, 1JH4, 2K8G, 2RQG, 2RQH, 2X04, 3KTP, 3KTR, 3KUI, 3KUJ, 3KUR, 3KUS, 3KUT, 3PKN, 3PTH, 4F02, 4F25, 4F26, 5DX1, 5DXA, 5DX8, 2D9P

識別子
記号PABPC1, PAB1, PABP, PABP1, PABPC2, PABPL1, poly(A) binding protein cytoplasmic 1
外部IDOMIM: 604679 MGI: 1349722 HomoloGene: 37638 GeneCards: PABPC1
遺伝子の位置 (ヒト)
8番染色体 (ヒト)
染色体8番染色体 (ヒト)[1]
8番染色体 (ヒト)
PABPC1遺伝子の位置
PABPC1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点100,685,816 bp[1]
終点100,722,809 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
15番染色体 (マウス)
染色体15番染色体 (マウス)[2]
15番染色体 (マウス)
PABPC1遺伝子の位置
PABPC1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点36,595,905 bp[2]
終点36,609,912 bp[2]
遺伝子オントロジー
分子機能 血漿タンパク結合
核酸結合
protein C-terminus binding
translation activator activity
poly(U) RNA binding
poly(A) binding
mRNA 3'-UTR binding
RNA結合
mRNA結合
細胞の構成要素 焦点接着
catalytic step 2 spliceosome
ストレス顆粒
細胞質
cytoplasmic ribonucleoprotein granule
spliceosomal complex

エキソソーム
細胞核
細胞質基質
樹状突起
リボ核タンパク質顆粒
シナプス
messenger ribonucleoprotein complex
リボ核タンパク質
生物学的プロセス ナンセンス変異依存mRNA分解機構
mRNA stabilization
mRNA splicing, via spliceosome
regulation of mRNA stability
RNAスプライシング
mRNA polyadenylation
mRNA processing
nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
positive regulation of viral genome replication
translational initiation
negative regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
positive regulation of translation
遺伝子サイレンシング
positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_002568

NM_008774

RefSeq
(タンパク質)

NP_002559

NP_032800

場所
(UCSC)
Chr 8: 100.69 – 100.72 MbChr 8: 36.6 – 36.61 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス
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機能

ポリ(A)結合タンパク質(PABまたはPABP)は真核生物のmRNAの3'末端のポリ(A)テールに複合体を形成しており、ポリ(A)鎖の伸長と翻訳の終結に必要なタンパク質である。PABPC1はPABPファミリーの一部を構成している[7]

PABPC1は通常は細胞質内に拡散して存在しており、ストレス顆粒英語版P-body英語版、翻訳活性の高い部位など、mRNAが高濃度で存在する部位に濃縮されている。PABPC1はNMDとも関係している。PABPC1はポリ(A)テールやeIF4G英語版と相互作用し、環状化したmRNAを安定化している。この構造はNMDを介したmRNA分解を防ぐために必要である[8]

PABPC1は核内ではpre-mRNAのポリ(A)テールに結合し、安定性、核外搬出、輸送、分解を促進している。PABPC1は4つのRNA認識モチーフ(RRM)を持つ。最初の2つ(RRM1とRRM2)は、α-インポーチンと、プロセシングされたmRNAの双方に結合する。この結合は、mRNAが核内へ送り返されることを防いでいる[6]

相互作用

PABPC1は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

出典

関連文献

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