Sp1転写因子

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Sp1転写因子(specificity protein 1)は、ヒトではSP1遺伝子によってコードされるタンパク質である[5]

PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
記号SP1, entrez:6667, Sp1 transcription factor
染色体12番染色体 (ヒト)[1]
概要 PDBに登録されている構造, PDB ...
SP1
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

1SP1, 1SP2, 1VA1, 1VA2, 1VA3

識別子
記号SP1, entrez:6667, Sp1 transcription factor
外部IDOMIM: 189906 MGI: 98372 HomoloGene: 8276 GeneCards: SP1
遺伝子の位置 (ヒト)
12番染色体 (ヒト)
染色体12番染色体 (ヒト)[1]
12番染色体 (ヒト)
SP1遺伝子の位置
SP1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点53,380,176 bp[1]
終点53,416,446 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
15番染色体 (マウス)
染色体15番染色体 (マウス)[2]
15番染色体 (マウス)
SP1遺伝子の位置
SP1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点102,314,578 bp[2]
終点102,344,839 bp[2]
RNA発現パターン
さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 protein homodimerization activity
HMG box domain binding
転写因子結合
ヒストンデアセチラーゼ結合
金属イオン結合
transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding
bHLH transcription factor binding
protein C-terminus binding
血漿タンパク結合
histone acetyltransferase binding
核酸結合
sequence-specific DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
DNA結合
二本鎖DNA結合
DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
DNA-binding transcription factor activity
RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
core promoter sequence-specific DNA binding
DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
細胞の構成要素 細胞質
核質
protein-DNA complex
細胞核
transcription repressor complex
生物学的プロセス positive regulation of hydrogen sulfide biosynthetic process
周期的プロセス
regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of transcription, DNA-templated
viral process
regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
snRNA transcription by RNA polymerase II
cellular response to insulin stimulus
positive regulation of transcription by RNA polymerase II
regulation of cholesterol biosynthetic process
positive regulation of gene expression
positive regulation of blood vessel endothelial cell migration
positive regulation of angiogenesis
positive regulation of vascular endothelial cell proliferation
ヒドロペルオキシドへの反応
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_001251825
NM_003109
NM_138473

NM_013672

RefSeq
(タンパク質)

NP_001238754
NP_003100
NP_612482

NP_038700

場所
(UCSC)
Chr 12: 53.38 – 53.42 MbChr 12: 102.31 – 102.34 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス
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機能

SP1遺伝子にコードされるSP1タンパク質はジンクフィンガー転写因子であり、多くのプロモーターのGCリッチモチーフに結合する。SP1タンパク質は、細胞分化、細胞成長、アポトーシス免疫応答、DNA損傷応答、クロマチンリモデリングなど多くの細胞過程に関与している。このタンパク質の活性はリン酸化アセチル化グリコシル化などの翻訳後修飾タンパク質分解によるプロセシングの影響を受け、アクチベーターとしてもリプレッサーとしても機能する[5]

ミトコンドリアフェリチン遺伝子(FTMT)の推定プロモーター領域に結合する転写の正の調節因子としてSP1、CREBYY1が、負の調節因子としてGATA2英語版FOXA1英語版C/EBPβ英語版が同定されている[6]。これらの調節因子のDNA結合活性に対するデフェリプロン英語版(DFP)の影響がクロマチン免疫沈降(ChIP)アッセイによって調べられている。これらの中で、SP1のみがDFP処理後に用量依存的なDNA結合活性の大幅な増大を示した。siRNAによるSP1のノックダウンによってDFPによるFTMTのmRNAレベルの増加はみられなくなることから、DFPの存在下ではSP1を介したFTMTの発現の調節が行われていることが示唆される。DFP処理はSP1の細胞質および核内での発現を増加させ、主に核内に局在させる[7]

構造

SP1は転写因子のSp/KLFファミリー英語版に属し、785アミノ酸長、81 kDaである。SP1転写因子はジンクフィンガーモチーフをもち、これを介してDNAに直接結合して遺伝子の転写を亢進させる。ジンクフィンガーはCys2/His2型で、5'-(G/T)GGGCGG(G/A)(G/A)(C/T)-3'のコンセンサス配列GCボックス英語版エレメント)に結合する。ヒトゲノム中には12,000か所程度のSP1結合部位が見つかっている[8]

応用

Sp1は芳香族炭化水素受容体エストロゲン受容体の双方に結合し、そして比較的一定のレベルで存在するため、これらの受容体の増加や減少の研究の際のコントロールタンパク質として利用される[9]

阻害剤

Streptomyces plicatus英語版によって産生される抗腫瘍性抗生物質であるプリカマイシン英語版や、アシュワガンダWithania somnifera由来のステロイドラクトンであるウィザフェリンA英語版はSp1転写因子を阻害することが知られている[10][11]

miR-375-5pは大腸がん細胞でSP1とYAP1の発現を大きく低下させる。SP1とYAP1のmRNAはmiR-375-5pの直接的な標的である[12]

相互作用

Sp1転写因子は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

出典

関連文献

外部リンク

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