Erste internationale Erfahrungen sammelte Timothy Kiptoo bei den Crosslauf-Afrikameisterschaften 2012 in Kapstadt, bei denen er in 36:26 min den vierten Platz im Einzelrennen belegte und in der Teamwertung die Goldmedaille gewann. Im Juni gewann er bei den Afrikameisterschaften in Porto-Novo in 13:22,38 min die Bronzemedaille im 5000-Meter-Lauf hinter seinen Landsleuten Mark Kosgei Kiptoo und Jonathan Maiyo. Im Jahr darauf wurde er bei den Crosslauf-Weltmeisterschaften 2013 in Bydgoszcz in 34:10 min 26. im Einzelrennen und gewann in der Teamwertung die Bronzemedaille hinter den Teams aus Äthiopien und den Vereinigten Staaten. 2016 beendete er dann seine aktive sportliche Karriere im Alter von 32 Jahren.