En 1894 trasportó los restos de su padre a Hungría; al año siguiente decidió instalarse en la región y jurar fidelidad al emperador. Para 1867 ya había sido elegido diputado de las Cortes húngaras en dos ocasiones, aunque en los dos casos rechazó el escaño. El 10 de abril de 1895, fue elegido de nuevo en el distrito electoral de Tapolca y en 1896 en el de Cegléd; para entonces ya participaba en la vida política de la región.
En el otoño de 1898, obtuvo la jefatura del Partido por la Independencia, opuesto a los sucesivos Gobiernos de Szell, Khuen-Héderváry, Szápáry y Esteban Tisza que se sucedieron entre 1898 y 1904. Gozó de gran influencia tanto en el Parlamento como entre la opinión pública merced a sus artículos publicados en Egyetértés. En los comicios de 1905, su partido obtuvo una amplia mayoría; en consecuencia, el monarca decidió la formación de un nuevo gabinete que presidió Sándor Wekerle y en el que Kossuth tuvo un papel destacado.