Couples comenzó a jugar al golf en el parque Jefferson de Seattle. Luego de la secundaria, obtuvo una beca deportiva en la Universidad de Houston, con la que fue campeón de la Southwestern Conference de la NCAA en 1979. Al año siguiente se convirtió en profesional, y en 1981 empezó a disputar regularmente el PGA Tour. En 1982 terminó tercero en el Campeonato de la PGA.
En 1983 logró su primera victoria en Congressional, tras lo cual acabó 19º en la lista de ganancias con siete top 10 y 15 top 25. En 1984 obtuvo el Players Championship, superando a Lee Trevino, Seve Ballesteros, Craig Stadler, Mark O'Meara, Lanny Wadkins y Nick Price. Con nueve top 10 y 19 top 25, se ubicó séptimo en la clasificación final.
Couples ganó en 1987 el primer puesto en el Byron Nelson, nueve top 10 y 15 top 25, para acabar 19º en la lista de ganancias del PGA Tour. En 1988 terminó 21º con diez top 10 y 19 top 25, aunque sin triunfos. El golfista tampoco ganó en 1989, pero con nueve top 10 y 17 top 25 se colocó 11º en la clasificación final. En 1990 venció en el Abierto de Los Ángeles, fue segundo en el Campeonato de la PGA y acumuló nueve top 10 y 13 top 25, con lo que terminó la temporada en la novena posición.
En 1991, Couples triunfó en el St. Jude y en Broome County, y acumuló cuatro terceros puestos y nueve top 10. Esto le significó acabar tercero en la lista de ganancias tras Corey Pavin y Craig Stadler. El golfista ganó en 1992 el Abierto de Los Ángeles, el Bay Hill Invitational y el Masters de Augusta, resultó segundo en el Abierto de Doral y el Honda Classic, acabó tercero en el Torneo de Campeones, Abierto del Oeste y la World Series of Golf, y cosechó 12 top 10 y 19 top 25. Así, conquistó el primer puesto en la clasificación final del PGA Tour 1992, superando a Davis Love III, John Cook y Nick Price.
Couples ganó en 1993 el Honda Classic, fue segundo en los abiertos de Los Ángeles y Canadá, consiguió nueve top 10 y 15 top 25, y terminó décimo en la tabla general. En 1992 obtuvo un triunfo en Warwick Hills y dos segundos puestos en el Torneo de Campeones y el Abierto de Los Ángeles. Pero con solamente cinco top 10 debió conformarse con el 23º puesto final.
En 1996 ganó por segunda vez The Players Championship. Sumado a nueve top 10 y 12 top 25, acabó sexto en la lista de ganancias del PGA Tour. En 1998 venció en el torneo de Coachella Valley y el Memorial Tournament, y fue segundo en el Masters de Augusta y el Byron Nelson y tercero en el Abierto de Houston. Sus diez top 25 le bastaron para terminar noveno en la clasificación final.
La última victoria de Couples en el PGA Tour fue en el Abierto de Houston de 2003. En 2004 fue sexto en el Masters de Augusta y en 2005 acabó tercero en el Abierto Británico. Luego resultó tercero en el Masters de Augusta de 2005 y sexto en 2010.
Después de cumplir 50 años de edad, Couples comenzó a disputar el Champions Tour en 2010. Ha logrado diez victorias, incluyendo dos torneos mayores: el Senior Players Championship de 2011 y el Abierto Británico de Veteranos. Ha resultado segundo en la lista de ganancias de 2010 y cuarto en 2013.
