Moerdijk fue el primer sudafricano que se convirtió en miembro del Royal Institute of British Architects.
De regreso a su país en 1913, el primer encargo que recibió fue la construcción de la iglesia de Bothaville, encargo que recibió tras ganar el concurso de adjudicación. Se le conoce por ser el autor de más de 80 iglesias en las que incorporó elementos de la arquitectura tradicional holandesa del Cabo: incorporación de cúpulas, cambio de planta en forma de cruz por una planta octogonal, ventanas elevadas, etc.
Fue el diseñador de numerosos bancos, hospitales, ayuntamientos y casas particulares. Destaca la construcción del reserve Bank en Bloemfontein y la biblioteca Merensky de la Universidad de Pretoria, declarada monumento nacional en 1991.
El monumento al voortrekker en Pretoria, está considerado como su obra maestra. El proyecto de Moerdijk fue aprobado en 1936 por la comisión de monumentos de los pueblos del centro y su construcción se inició en 1937.
La Academia Sudafricana de Artes y Ciencias le nombró miembro honorario en 1936 y en 1950 la Universidad de Sudáfrica le nombró doctor honoris causa.
