Japan Football League 1999

Después de la disolución de la antigua Japan Football League para formar la J. League Division 2, la nueva Japan Football League se estableció a partir de esta temporada como la principal división nacional para clubes amateurs. Originalmente se planeó tener 8 equipos, incluidos siete ex clubes JFL y Yokogawa Electric, ascendido desde la Liga de Fútbol del Kantō, una de las nueve ligas regionales japonesas. Pero finalmente se convirtió en un torneo de nueve clubes al aceptar a Yokohama F.C., fundado por los seguidores del difunto Yokohama Flügels, como miembro asociado como una medida extralegal. Los nueve conjuntos disputaron 24 partidos cada uno, en formato de triple round-robin. Yokohama F.C. ganó el campeonato pero bajo las condiciones de su membresía asociada no era elegible para el ascenso y tuvo que permanecer en JFL durante el próximo año.