Koné nació en Bamako, Mali en 1977.[2] Se graduó en la Escuela Militar de Armas Combinadas de Kati. Tras su paso por la academia, continuó su formación en la Escuela militar interarmas de Kulikoró y realizó cursos de capacitación en China.[2][3] Tras completar su formación, Koné sirvió en la Guardia Nacional de Malí, donde combatió contra grupos rebeldes. Se sabe que estuvo destinado en Konna al comienzo de la guerra de Malí y que probablemente participó en la batalla de Konna.[3]
Participó en el golpe de Estado en Malí de 2020 como parte del Comité Nacional para la Salvación del Pueblo (CNSP) como tercer vicepresidente, después de Assimi Goïta y Ba N'Daou respectivamente.[4][5] En octubre de 2020 fue nombrado ministro de Seguridad y Protección Civil en el gobierno de transición de Moctar Ouane.[6] En mayo de 2021, tanto Koné como el ministro de Defensa, Sadio Camara, fueron apartados del nuevo gabinete propuesto por Ouane. Su derrocamiento supuestamente llevó, en mayo de 2021, al coronel Assimi Goita a lanzar un «golpe dentro de un golpe» cuando Goita asumió el poder y ordenó el arresto de Ndaw y su gabinete durante el Golpe de Estado en Malí de 2021, lo que provocó que las Naciones Unidas y muchos gobiernos condenaran el golpe y pidieran la liberación de los líderes detenidos.[7][8][5][9][10]
Koné fue una de las cinco figuras principales del CNSP después del golpe de Estado de 2021, junto con Camara y Goita, Malick Diaw e Ismaël Wagué.[3] En el momento del golpe de Estado, era coronel.[3] En octubre de 2021 fue nombrado director general de la Agencia Nacional de Seguridad del Estado (ANSE), el servicio de inteligencia maliense.[11] En diciembre de 2025, una investigación publicada por Jeune Afrique reveló que la compra de drones turcos Bayraktar por parte del gobierno maliense fue autorizada por la ANSE de Koné, un hecho inusual ya que el Ministerio de Defensa de Camara es tradicionalmente el comprador de armas extranjeras.[12]
Durante los ataques de Mali de 2026, Koné y el jefe del Estado Mayor del Ejército, Oumar Diarra, resultaron gravemente heridos tras recibir disparos en el pecho durante los combates en Kati, en medio de los ataques perpetrados por yihadistas del Grupo de Apoyo al Islam y los Musulmanes (GSIM) y rebeldes separatistas tuareg del Frente de Liberación de Azawad (FLA).[13][14] Según informó The Guardian, Koné murió al día siguiente debido a las graves heridas que sufrió.[15] Su muerte no ha sido confirmada oficialmente por el Gobierno de Malí.