Sus padres fueron Odriolfo Padilla, carpintero, y de Eleonor de la Mar, maestra. Desde pequeño su madre lo llevaba a las clases que ella daba y notó que Pedro demostraba mucho interés en la escuela. En 1936, Pedro comenzó a leer y su madre lo inscribió en la escuela. A los 12 años escribió su primer cuento corto titulado “La puerta del carpintero”. En 1945, su padre murió de pulmonía. Pedro fue muy afectado por la muerte de su padre lo cual demostró mucho en su escritura. Durante los próximos dos años desarrolló un estilo pesimista de escribir. Dedicaba la mayoría de su tiempo a escribir y produjo tales como “El gallo sin cresta”, “Vivir sin razón”, y “La bailarina que perdió su pierna”. En 1948, Pedro se casó con Clara Zapata, una de sus pocos amigos.
En 1949, emigró a Campo Azul, Colombia, donde tuvo su primer hijo llamado Odriolfo, en nombre de su padre. Allí escribió múltiples cuentos como “La terecina” y “El cartero sin cartas”. En 1951, comenzó a trabajar en las siembras de café. Fue aquí donde conoció a su futura amante, Isabel Molina. Isabel lo ayudó a superar la muerte de su padre y fue la inspiración de varios cuentos entre ellos “Amor en el cafetal”.
En 1955, tuvo un accidente donde un pedazo de maquinaria le perforo un pulmón y le impidió volver a trabajar. Obligado a estar en cama debido a su pulmón débil, Pedro siguió escribiendo en su hogar. En 1956, escribió lo que es considerado su mejor cuento, “El cepillo de Sion”. Ese mismo año comenzó a escribir su primera novela pero quedó a mitad debido a que el 17 de agosto de 1957 sufrió de un ataque de asma que su pulmón no pudo soportar y falleció.
