Proteína quinasa R

gen de la especie Homo sapiens From Wikipedia, the free encyclopedia

La proteína quinasa R (PKR, del inglés protein kinase R) también llamada quinasa dependiente de ARN de doble cadena inducida por interferón; quinasa 2 del factor eucariótico iniciador de la traducción 2-alfa; proteína quinasa activada con ARN o simplemente p68 es una proteína quinasa involucrada en sensar el estrés intracelular.[2] En humanos, es codificada por el gen HGNC EIF2AK2 (NCBI RefSeq ID: NG_030351.1).[3]

PDB Buscar ortólogos: PDBe, RCSB
Lista de códigos PDB
2A1A
Estructuras enzimáticas
Nomenclatura
Otros nombres
eIF-2A-PK2, P1/eIF-2A-PK, p68
Datos rápidos Estructuras disponibles, PDB ...
Proteína quinasa R

Modelo 3D del motivo dsRBD unido a ARN de doble cadena (PDB ID: 1DI2); imagen hecha con el visualizador VMD.[1]
Estructuras disponibles
PDB Buscar ortólogos: PDBe, RCSB
Lista de códigos PDB
2A1A
Estructuras enzimáticas
Identificadores
Nomenclatura
Otros nombres
eIF-2A-PK2, P1/eIF-2A-PK, p68
Símbolo 9437
Identificadores
externos
Bases de datos de enzimas

BRENDA: entrada en BRENDA

ExPASy: NiceZime view
KEGG: entrada en KEEG
PRIAM: perfil PRIAM
ExplorEnz: entrada en ExplorEnz
MetaCyc: vía metabólica
Número EC 2.7.11.1
Locus Cr. 2 p21-22.2
Estructura/Función proteica
Tamaño 551 (aminoácidos)
Peso molecular 68000 (Da)
Ortólogos
Especies
Humano Ratón
Entrez
5610
UniProt
P19525 n/a
PubMed (Búsqueda)


PMC (Búsqueda)
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Historia

Esta enzima fue descubierta en la década de los años 80, cuando se estudiaba el efecto que tenía el ARN de doble hebra para inhibir la síntesis de proteínas en un sistema libre de células; asimismo, durante esa década se caracterizó su actividad de cinasa, identificándose dos etapas: su autofosforilación tras la interacción con ARN de doble cadena y, posteriormente, la fosforilación de diferentes residuos de serina/treonina en la subunidad alfa del factor eucariótico iniciador de la traducción (eIF2-α, por sus siglas en inglés).[4][5] Durante la década siguiente, se describieron la secuencia de nucleótidos que codifica para la PKR humana y su correspondiente secuencia de aminoácidos; se determinó que esta posee, hacia su extremo N-terminal, dos motivos de unión a ARN de doble cadena (ver imagen a la derecha) denominados dsRBD (acrónimo de double-stranded RNA Binding Domain) y un dominio cinasa, en el extremo C-terminal, unidos por una secuencia de 100 aminoácidos.[6][7]

Actividad

Una de las primeras respuestas celulares que ocurre durante las infecciones virales es la producción de interferones que a su vez induce la activación de proteínas antivirales, como la PKR que inhibe al eIF2-α,[8] interumpiendo así el ciclo replicativo del virus que ha infectado a la célula, además de activar vías de señalización pro-apoptóticas.[5] Se sabe que la activación de esta enzima ocurre mediante la interacción de sus dominios dsRBD con ARN de doble hebra, el cual está presente muchas infecciones virales; sin embargo, en ensayos in vitro se ha observado que otros compuestos polianiónicos como la heparina también pueden activar a la PKR.[9][10]

Referencias

Enlaces externos

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