Esta zona, al igual que todo el Valle de Elqui, estuvo poblada por nativos de la cultura tanto diaguita del período clásico como de la época de la dominación inca.
Tanto Francisco de Aguirre como Miguel Nicolás Pinto de Escobar son considerados los pioneros de la industria vitivinícola del Valle de Elqui.
Históricamente se cree que la casa patronal de Miguel Nicolás Pinto de Escobar y su descendencia de quince hijos se encontraba en lo que es hoy la Quebrada de Pinto; de ahí la denominación del pueblo.