Fue inaugurado en marzo de 1997 y sustituyó al obsoleto refugio Félix Méndez que estaba a una altitud de 3.000 metros y que aún sigue siendo recordado por los montañeros, ya que permitía un acceso más corto y rápido a los grandes tres miles (Pico Veleta y Mulhacén). Hubo por ello numerosas protestas por parte de clubes montañeros solicitando la construcción del actual Poqueria a mayor altura, sin resultado positivo.
El refugio es propiedad de la CMM y el parque nacional. Está gestionado por la Federación Andaluza de Montañismo, con Ansi Moslero y Rafael Quintero como Equipo Oficial de Guardería, manteniendo permanentemente abiertas estas instalaciones desde su inauguración en 1997. Cuentan para ello con la inestimable ayuda de amigos, colaboradores y ayudantes.
El Refugio Poqueira es una instalación deportiva cuyo objetivo principal es facilitar/potenciar la práctica del montañismo y otros deportes relacionados. Su personal realiza también otras labores fundamentales, como servir de apoyo para labores de rescate y emergencias, dar apoyo a la investigación, gestión de residuos, limpieza diaria, restauración y alojamiento, aprovisionamiento de recursos, atención a montañeros, mantenimiento de instalaciones y de materias primas y administración.
Poqueira cuenta con un salón comedor con chimenea, siete dormitorios, aseos y duchas, cocina libre, terraza, rocódromo y helipuerto, etc. Para facilitar la práctica de montañismo, se alquila material de montaña (botas y ropa).
Es, junto con el Refugio Postero Alto, uno de los refugios más importantes de Sierra Nevada.