Según al geógrafo e historiador griego Estrabón, Sinuessa derivaría del topónimo en latínsinus, nombre con el que se le conocía al cercano Golfo de Gaeta.
Sinuessa pareció haber crecido en importancia, pero fue severamente devastada en el 217a.C. por Aníbal, cuya caballería llegó hasta las mismas puertas de la ciudad. Posteriormente trató de tener un ejército mancomunal con la cercana Minturnae. Su posición en la Vía Apia, sin duda, contribuyó en gran medida a su prosperidad, se menciona con frecuencia que Julio César se detuvo allí durante sus viajes desde Brindisi a Roma, sobre todo en el 49a.C.
Ya en época imperial, los siglos I y II fueron un momento muy floreciente para la localidad, ya que numerosos senadores y caballeros romano construyeron lujosas villas en ella, condición que se vio reforzada con la construcción e inauguración de la via Domiciana en el año 96, lo que comvirtió a Sinuessa en un importante foco comercial, relacionado con el moderno e importante puerto de Puteoli. Así mismo, sus termas fueron muy famosas en esta época y era bien conocida por la producción del vino Falerno.
Con el final del Imperio romano, fue saqueada por los bárbaros, pero su abandono definitivo se produjo por los fenómenos telúricos, típicos de esta zona de Italia, conocidos como bradisismo y relacionados con los campos Flegreos, que terminaron por sumergirla y obligaron a sus habitantes a abandonarla.
En la ficción
En la última temporada de Spartacus, serie producida por Starz y DeKnight Productions, el ejército rebelde toma la ciudad por varios días, en esta, la ciudad es muy poblada y un punto importante de comercio para Roma, lo que supone un golpe crucial por parte de los rebeldes de Spartacus, los cuales saquearon la ciudad hasta que fue recuperada por Craso.