Stephen Maturín (Esteban Maturin y Domanova), católico, es el hijo ilegítimo de un oficial irlandés del Ejército español y de una dama española. Es primo del histórico Lord Edward FitzGerald (1763-1798). De niño vivió en Irlanda, y pasó su adolescencia en Cataluña. Habla numerosos idiomas y escribe su diario en catalán. Estudió en el Trinity College de Dublín y, posteriormente, calificó como médico en la Sorbona.
Estuvo en París durante el estallido de la Revolución francesa en 1789, de la que fue en primer lugar, un ardiente defensor. Volviendo a Irlanda fue miembro de la Sociedad de irlandeses Unidos y al parecer se comprometió con una mujer llamada Mona, que murió en circunstancias no especificadas. Estuvo en contra de la rebelión irlandesa de 1798 y se negó a participar.
En 1800 viajó a Menorca con un paciente que falleció allí, dejándolo sin dinero y abandonado. Un desagradable encuentro con Jack Aubrey, que pudo haber a acabado en un duelo, le valió su amistad y la posición del cirujano a bordo del buque HMS Sophie.
Como defensor de la independencia catalana de España, y un decidido oponente de la tiranía de Bonaparte, Maturín comenzó a participar en inteligencia secreta, aunque nunca aceptó el pago por sus servicios.
Además de sus actividades como médico y espía, Maturin es un célebre naturalista (miembro de la Royal Society), con un interés particular en las aves, y es el descubridor de la entonces desconocida especie de tortugas que, en honor a su amigo Jack Aubrey bautizó como Testudo Aubreii. También toca el violonchelo y la flauta.
Es descrito como un hombre no muy alto, delgado y moreno (resultado de su herencia Hiberno-española y por su gusto de tomar sol), a pesar de que tiene curiosos ojos azules claros. Pesa 56 kg. Muy desordenado, durante un tiempo comparte alojamiento con Jack, que lo considera un poco marrano. No se preocupa por su apariencia y gasta lo menos posible en ropa, a pesar de poseer un porcentaje considerable de premios obtenidos a través de los años, y una fortuna heredada de su abuelo catalán en 1812.
Maturín habla fluidamente catalán, inglés, español, francés y latín, también puede hablar irlandés, leer portugués, y tiene conocimientos de griego, malayo, árabe y urdu. Sin embargo es incapaz de aprender la jerga naval.
En 1802 conoce y se enamora de Diana Villiers, con quien finalmente (después de muchos avatares) se casa en 1813 o 1814. Tienen una hija, Brigid, antes de la muerte de Diana en 1815 en un accidente de carroza. A continuación, comienza una relación con la naturalista Christine Hatherleigh Wood, a quien le propone matrimonio, aunque esto queda sin resolver al final de la serie.
