Amorce (génétique)

En biologie moléculaire, l'amorce est une courte séquence d'ARN ou d'ADN, complémentaire du début d'une matrice, servant de point de départ à la synthèse du brin complémentaire de cette dernière matrice par une ADN polymérase.

La PCR nécessite l'utilisation d'une amorce « sens » et d'une amorce « anti-sens », mesurant généralement 17 à 25 paires de bases et permettent de définir la séquence de l'amplicon. L'amorce sens possède la même séquence que le brin codant, tandis que l'amorce anti-sens possède la séquence complémentaire dans le sens inverse au brin matrice.

Ces amorces vont s'hybrider avec les brins d'ADN durant la phase d'hybridation et permettent à l'ADN polymérase de polymériser les séquences complémentaires.

Durant la réplication de l'ADN, des amorces ARN, de 4 à 12 nucléotides^[1], vont êtres synthétisées par la primase et vont permettre à l'ADN polymérase de commencer la polymérisation. Ces amorces seront ensuite digérées et remplacées par les séquences d'ADN correspondant.

• En séquençage, on n'utilise qu'une seule des deux amorces du produit de PCR qu'on veut séquencer. Il ne faut pas avoir les deux séquences « sens » et « anti-sens » à passer ensemble dans le séquenceur, ce qui donnerait un résultat d'électrophorèse sur gel difficile à interpréter, autrement dit un électrophorégramme illisible^[Quoi ?].

L'amorce est synthétisée par une enzyme particulière, la primase.