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En 1999, elle commence à travailler pour la Cadena SER. Elle intègre l'équipe d'Iñaki Gabilondo et se spécialise dans l'actualité internationale. Elle a été envoyée spéciale dans diverses régions du monde[2].
Elle dirige et présente l'émission hebdomadaire Punto de fuga, où elle reçoit des personnalités de la vie politique ou culturelle[3].
Interview du président du gouvernement espagnol José Luis Rodríguez Zapatero en janvier 2011 dans Los desayunos de TVE.
Le , le porte-parole du Parti populaire l'accuse de faire un travail biaisé et manquant d'objectivité et insinue la possibilité de la renvoyer si son parti gagnait les élections[6]. Ces déclarations entraînent une polémique, Ana Pastor ayant reçu plusieurs prix récompensant au contraire l'impartialité de son travail, comme le Prix Liberté d'Expression 2011 délivré par l'Association de presse espagnole (Asociación Profesional Española de Informadores de Prensa, Radio, Televisión e Internet)[7],[8]. Elle reçoit également le prix Protagonistas en 2011.
Le est annoncée son éviction de la direction de Los desayunos de TVE. RTVE justifia cette décision en affirmant qu'on lui aurait fait la proposition d'un autre programme, qu'elle aurait déclinée, faits démentis par l'intéressée[9],[10].
En , elle est choisie par CNN pour présenter un programme dans lequel elle s'entretient avec des personnalités nationales ou internationales issues de divers milieux[11].
