Andy Mikita fait ses débuts à la télévision en tant que second assistant réalisateur sur la série 21 Jump Street. De 1989 à 1996, il travaille sur plusieurs autres séries en tant que premier assistant réalisateur, dont Cobra (1993-1994) et La Légende d'Hawkeye (1994-1995) ; ce qui le mènera, en 1997, a rejoindre l'équipe de Stargate SG-1, et en 1999, a faire ses débuts comme réalisateur, sur l'épisode Invasion (S03 E14 - Foothold).
Mikita fait ses débuts d'acteur lors un caméo dans l'épisode Wormhole X-Treme, le 100e de la série Stargate SG-1. Il apparait également en tant qu'invité au mariage lors du 200e épisode, Wormhole X-Treme, le film.