Blason d'Anne III de Stolberg dans l'abbaye de Quedlinbourg.
AnneIII est élue pour succéder à ÉlisabethII de Regenstein (1542-1584), abbesse de Quedlinbourg. L'élection de la nouvelle princesse-abbesse est confirmée par l'empereur RodolpheII le . Elle est fréquemment confrontée au conseil de la ville et au protecteur de l'abbaye impériale, l'électeur AugusteIer de Saxe, et fait appel au soutien de l'empereur. Les divergences avec le conseil municipal peuvent être résolus jusqu'en 1589.
AnnaIII meurt soudainement, âgé de 36 ans, après une promenade dans les jardins de Quedlinbourg. La cause officielle de sa mort est une attaque cérébrale. Marie de Saxe-Weimar a été élue pour lui succéder.