Het menselijk liberalisme. Een antwoord op het antiglobalisme - 2002
Pleidooi voor individualisme - 2004
De derde feministische golf - 2006
Pius XII en de vernietiging van de Joden - 2008
John Stuart Mill 150 jaar over vrijheid (red.) - 2009
Het liberale denken van Thomas Paine (red.) - 2009
Een historisch en moraalwetenschappelijk onderzoek naar de morele verantwoordelijkheid van paus Pius XII ten aanzien van de Endlösung der Judenfrage - 2010
Atheïsme als basis voor de moraal (essay) - 2010
Vrijzinnigen veroordelen pedofielen. Het Vaticaan beschermt ze (essay) - 2011
Naar een strijdvaardig atheïsme (essay) - 2011
Dirk Verhofstadt in gesprek met Etienne Vermeersch. Een zoektocht naar waarheid - 2011
De Laatste Getuigen (co-auteur Luckas Vander Taelen) - 2011
Media en ethiek Editie 1 - 2012
De open samenleving onder vuur (red.) - 2012
Dirk Verhofstadt in gesprek met Paul Cliteur. Een zoektocht naar harmonie - 2012
De katholieke kerk in de ban van een onmenselijke utopie (essay) - 2012
Vroeger was het niet beter (essay) - 2012 (in Lust en het goede leven, Klerx, H. en Hinten-Nooijen, J.M., 2012, Uitgeverij Valkhofpers, Tilburg University)
Rechtvaardigheid als liberaal kernbegrip (essay) - 2012
A Plea for Individualism (essay) - 2013
Media en ethiek Editie 2 - 2013
Pius XII. und die Vernichtung der Juden - 2013
Atheïsme als basis voor de moraal - 2013
Media en ethiek Editie 3 - 2014
1914. Het vervloekte jaar - 2014
Cesare Beccaria. 250 jaar over misdaden en straffen - 2014
De Liberale Canon. Grondslagen van het liberalisme - 2015
Media en ethiek Editie 4 - 2015
Het Atheïstisch Woordenboek (co-auteur Paul Cliteur) - 2015
De vier vrijheden van Franklin Delano Roosevelt (essay) - 2016
Media en ethiek Editie 5 - 2016
Il Vaticano e l'Olocausto ungherese - 2016 (in Con Dio e con i fascisti, Karlheinz Deschner, 2016, Massari Editore)
Salafisme versus democratie - 2016
Theorieën over rechtvaardigheid. De John Rawlslezingen (red.) - 2017
Media en ethiek Editie 6 - 2017
De geschiedenis van het liberalisme - 2017
Media en ethiek Editie 7 - 2018
In Naam van God (co-auteur Paul Cliteur) - 2018
Media en ethiek Editie 8 - 2019
Beroemde Feministes (red.) - 2019
De liberale ideologie. Voorbij het links-rechts denken - 2019
Nagelaten geschriften van Etienne Vermeersch (red. met Johan Braeckman) - 2019
Ide Leib Kartuz. Kleermaker in Auschwitz (co-auteur David Van Turnhout) - 2019
