La FCI est dirigée par un conseil d’administration formé d’au plus treize personnes provenant de divers milieux. Chaque administrateur ou administratrice apporte une perspective et une compréhension du milieu de la recherche ainsi qu’une expertise acquise, soit dans le secteur privé ou institutionnel, soit dans le milieu de l’enseignement postsecondaire[1].
Le gouvernement du Canada, par décret du gouverneur en conseil, nomme six administrateurs ou administratrices dont la personne qui occupe la présidence. Les autres administrateurs et administratrices sont nommés par les Membres de la FCI. Leur mandat dure trois ans[1].
Les Membres constituent une entité décisionnelle supérieure qui représente le public canadien et dont relève le conseil d’administration de la FCI. À la suite d’un examen minutieux des candidatures possibles, les Membres désignent leurs remplaçants et remplaçantes pour des mandats de cinq ans. Les Membres se réunissent une fois par année en juin et sont responsables de la nomination de sept administrateurs et administratrices, de la sélection d’une firme d’audit externe, de l’examen des états financiers audités et de l’approbation du rapport annuel[1],[2].
Le président-directeur général (PDG) ou la présidente-directrice générale de la FCI est nommé(e) par le conseil d’administration de la FCI[1].