Le Gymnasium est fondé lors de l'année scolaire 1973-1974 et prend en charge des élèves auparavant au Röntgen-Gymnasium qui, avec 1 800 élèves, est alors le plus grand Gymnasium de Bavière. Il est baptisé en hommage à Friedrich Koenig, l'inventeur des presses d'imprimerie mécanisées. L'école adhère au projet Comenius avec des écoles d'Oulu en Finlande, de Hasselt en Belgique et de Vérone en Italie.
En 1991, on y enseigne l'économie. Dans l'après-midi, les élèves participent au programme de pensionnat du diaconat de Wurtzbourg.
Fin 2001, l'école sert de lieu d'exposition pour l'exposition itinérante Wir hatten noch gar nicht angefangen zu leben sur les jeunes dans les camps de concentration nazis de Moringen et d'Uckermark.
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