Il vient d'une famille noble originaire de Kulmbach en Haute-Franconie. Ses ancêtres se sont appauvris, une partie de la famille est connue pour être des voleurs.
La nomination de Friedrich von Wirsberg arrive dans un temps agité: afin de renforcer sa position et de faire respecter le retour de ses biens, Wilhelm von Grumbach(de) tente d'enlever le prince-évêque Melchior Zobel von Giebelstadt, deux fois en vain avec Diener et son bras droit Kretzer; la troisième fois, en , Melchior Zobel est assassiné avec ses courtisans Fuchs von Winfurt et Carl von Wenkheim. Les meurtriers s'échappent. Grumbach nie sa participation, mais personne ne le croit, il fuit en France comme l'avait fait Albert II Alcibiade de Brandebourg-Kulmbach. Friedrich von Wirsberg, nommé successeur de Melchior Zobel von Giebelstadt, anime la recherche des assassins. Kretzer est pris à la frontière avec la France et est pendu sans procès.
Le cloître des clarisses de Wurtzbourg, fondée en 1520, est abolie en 1560 par Wirsberg. Les bâtiments sont confiés aux Jésuites en 1567.
En 1560, Friedrich von Wirsberg expulse les Juifs de Würzburg et des autres villes du diocèse. Selon l'historien Arno Herzig, cette mesure se fait en accord avec son secrétaire Julius Echter von Mespelbrunn et d'autres évêques de l'Empire.
Afin d'assurer une éducation catholique, il fonde un gymnasium le .
Wissenschaftliche Vereinigung für den Deutschen Orden e.V. und Historische Deutschorden-Compaigne zu Mergentheim 1760 e.V. (Hrsg.): 1300 Jahre Würzburg - Zeichen der Geschichte, Bilder und Siegel der Bischöfe von Würzburg. Heft 23. Lauda-Königshofen 2004. S.46.