Il quitte sa ville natale Hanovre pour aller étudier à l'université de Göttingen et publia une thèse en 1819 sur l'histoire des maires du Palais mérovingiens. Sa thèse attira l'attention du baron Stein, qui l'engagea en 1820 pour éditer les chroniqueurs mérovingiens pour le compte de la Société historique d'Allemagne, nouvellement créée.
Dans ce but, Pertz voyagea en Allemagne et en Italie à la recherche de sources, et publia à son retour en 1823 la série des Monumenta Germaniae Historica, rassemblant les textes de tous les plus importants historiens concernant l'Allemagne jusqu'aux années 1500, ainsi que les textes de lois, les archives impériales et royales et des correspondances.
En 1821, il fut nommé secrétaires aux archives, et en 1827 conservateur principal de la bibliothèque royale de Hanovre.
Il édita de 1832 à 1837 le Hannoverische Zeitung(de), et fut élu représentant à la seconde chambre hanovrienne.
En 1833, il redécouvre dans la Bibliothèque d'État de Bamberg les Quatre livres d'histoire (991-998) de Richer de Reims, connus sous le nom d'Histoire, chronique qui éclaire les événements relatifs à la chute des Carolingiens, l'avènement des Capétiens, les irruptions normandes de 885 à 888 et à la lutte entre Louis d'Outremer et de Lothaire et Hugues le Grand.
En 1845, il fut nommé libraire en chef à Berlin, puis membre de l'Académie des sciences de Prusse.
Il démissionna de toutes ses charges en 1874, et mourut à Munich.
Son œuvre
Les Monumenta commencèrent à paraître en 1826, et comprirent en tout 24 volumes dans les séries Scriptores, Leges, et Diplomata.
Pertz publia également:
une sélection de textes au format in-octavo: les Scriptores rerum germanicarum in usum scholarum;
Werner Ohnesorge: Fünf Briefe von Georg Heinrich Pertz. In: Hannoversche Geschichtsblätter, Neue Folge 21 (1967), S. 183–196.
Horst Fuhrmann: „Sind eben alles Menschen gewesen.“ Gelehrtenleben im 19. und 20. Jahrhundert. Dargestellt am Beispiel der Monumenta Germaniae Historica und ihrer Mitarbeiter. Beck, München 1996, (ISBN3-406-40280-1) (online).
Falk-Reimar Sänger: Das Geburtshaus des Historikers Georg Heinrich Pertz. Ein Geschichtsdenkmal. In: Berichte zur Heimatpflege in Niedersachsen, Jahrgang 15 (1995), S. 46–49.
Hans-Christof Kraus: Archivarbeit für Preußen. Symposion der Preußischen Historischen Kommission und des Geheimen Staatsarchivs Preußischer Kulturbesitz aus Anlaß der 400. Wiederkehr der Begründung seiner archivalischen Tradition (= Veröffentlichungen aus den Archiven Preußischer Kulturbesitz. Arbeitsberichte. Bd. 2). Selbstverlag des Geheimen Staatsarchivs, Berlin 2000, S. 319–347.
