Né à Asuncion en Paraguay, Isidro Pitta est formé par le Cerro Porteño, où il s'illustre comme buteur prolifique en équipes de jeunes[1],[2].
Après un bref passage chez le club portugais d'Alvarenga à Arouca, où il joue en championnat de district amateur au cours de la saison 2017-18, Pitta rejoint le Deportivo Santaní, où il commence sa carrière professionnelle en championnat du Paraguay[1].
Il joue son premier match avec l'équipe première du club le contre le Club Olimpia. Entré en jeu, il marque son premier but dans ce match de championnat qui se termine sur le score de 2-2[1],[2].