Le complexe de Koyasan comprend :
- le Kongōbu-ji, construit par Kūkai en 816 comme l'étape principale du bouddhisme ésotérique sur un bassin montagneux à huit cents mètres d'altitude ;
- le Jison-in, construit comme une dépendance administrative pour faciliter la construction et la gestion de Kongōbu-ji ;
- le Niukanshōfu-jinja, construit comme « sanctuaire gardien » pour protéger la propriété Niukanshofu de Kongobu-ji ;
- le Niutsuhime-jinja, un sanctuaire shinto situé dans le bassin Amano entre Kongobu-ji et Jison-in. Étroitement lié à Koyasan, il consacre Koya Myōjin qui, selon la légende, a donné des terres à Kūkai quand celui-ci a choisi le complexe de Kongobu-ji, et Niu Myōjin qui l'a guidé.
Tous ces lieux saints sont reliés par la route du pèlerinage Kōyasan Choishimichi.
