Thiele fait paraître de 1929 à 1935 son Handbuch der Systematischen Weichtierkunde (ou Manuel de malacologie systématique) en deux volumes. Il modifie le concept développé par Henri Milne-Edwards (1800-1885) en 1848 et propose trois sous-classes: les Prosobranchia, les Opisthobranchia et les Pulmonata. C’est l’ouvrage de référence de cette discipline durant tout le XXe. En 1992, il est réédité et traduit en anglais par R. Bieler et P. M. Mikkelse sous le titre de Handbook of Systematic Malacology. En 1993, il est réédité en allemand. Ce n’est que durant ses dernières années, sous l’impulsion d’études phylogénétiques que sa classification est modifiée.
