Après avoir fini ses études à Friedberg en Hesse, Joseph Pascher entre au séminaire de Fulda. En 1916, il est ordonné prêtre. De 1916 à 1920, il est aumônier à Willmars mais étudie également les mathématiques, les langues orientales et obtient son doctorat en 1921 à Frankfurt. À partir de 1920, le P. Pascher travaille comme enseignant à l'école secondaire de Wiesbaden En 1928 il obtient son doctorat en théologie à Wurtzbourg.
Après son habilitation en théologie fondamentale en 1929, il est professeur agrégé d'apologétique à l'université de Wurtzbourg. Après la fermeture de la faculté de théologie catholique de Wurtzbourg en 1936, il s'installe à Munich afin d'y enseigner l'éducation religieuse. Après la fermeture de la faculté de Munich en 1939, il travaille à l'université de Münster en tant que professeur associé de théologie pastorale. En 1946, il devient doyen de la Faculté de théologie catholique et professeur titulaire. Dès l'été 1946, il devient professeur de liturgie, d'homélie et de théologie pastorale à Munich. Pendant son séjour à Munich, il est à la fois doyen de la Faculté et président de l'université Louis-et-Maximilien de Munich de 1958 à 1959. Il prend sa retraite en 1960, après avoir été le professeur de nombreux futurs théologiens dont faisait partie le futur pape Benoît XVI.
