Il devient alors conservateur au muséum d’agriculture du Berlin. Il reçoit son habilitation en 1874. Wittmack enseigne la botanique à l’institut agricole de Berlin de 1880 à 1913 (qu’il dirige de 1910 à 1913) ainsi qu’à l’école vétérinaire de 1880 à 1920. Il dirige également la station expérimentale Verband Deutscher Müller de 1875 à 1905 et la revue de botanique Gartenflora fondée en 1852 par Eduard von Regel.
