Marie Duhamel est la fille d'une musicienne de Nancy, Mme Duhamel, et d'un commerçant ; elle naît en Angleterre, lors d'un des voyages de commerce de son père[3]. À la mort de son père, sa mère se remarie, et Marie se retrouve la fille aînée d'une famille de neuf enfants[3].
Jeune fille, elle fréquente assidûment la rue des Dominicains de Nancy avec sa sœur Suzanne et sa cousine Margueritte[3].
Elle épouse en 1898 l'artiste Victor Prouvé, rencontré chez les Hekking, une famille de musiciens[1],[3].
Excellente pianiste, elle élève ses sept enfants dans la musique : sa fille Marianne remporte ainsi le premier prix du conservatoire au piano, et son fils Victor devient premier violon à l'orchestre symphonique de Nancy[3].