De 1995 à 2001, Höveler-Müller étudie l'égyptologie, la préhistoire et la protohistoire, la sémitique et les religions comparées à l'université de Bonn, où il participe également à la création et à l'aménagement du musée égyptien de l'université de Bonn entre 1998 et 2001. À Bonn, il collabore à de nombreuses expositions (notamment Tutanchamun - Das goldene Jenseits (2004/2005) au Musée fédéral des Beaux-Arts de Bonn).
En 1998, il participe aux fouilles de l'Institut archéologique allemand du Caire (DAI) dans le cimetière royal protohistorique d'Abydos, en 2000 aux fouilles du DAI à Éléphantine/Assouan (documentation sur la céramique nubienne) et en 2001 aux fouilles du Roemer- und Pelizaeus-Museum Hildesheim dans Pi-Ramsès, la ville de Ramsès II (Qantir, delta oriental). De 2009 à 2011, il dirige le musée égyptien de l'université de Bonn.
