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Il a également enseigné le journalisme en Afrique et a collaboré avec tous les grands journaux québécois et canadiens. Il a couvert neuf élections fédérales, six élections québécoises, trois référendums, plusieurs élections présidentielles aux États-Unis, deux en Afrique, une en France et l'élection d'un pape.
Depuis les années 1990, il a également animé plusieurs émissions à Canal D, à TVA et à Télé-Québec. Il a animé une émission de politique avec Paul Larocque (Larocque-Auger) à TVA entre 2005 et 2006.
Il a participé à l'émission Indicatif présent de Marie-France Bazzo à Radio-Canada, toutes les semaines, en tant que chroniqueur, jusqu'à la fin de l'émission, en .
Il a coanimé également le magazine d'affaires publiques Dernière édition à Télé-Québec, en compagnie d'Yves Boisvert. Michel C. Auger a tenu également un blogue sur le portail cyberpresse.ca où il commentait l'actualité et dialoguait avec les internautes, de 2006 à 2007.
Depuis l'automne 2008, il est analyste politique principal pour Radio-Canada. À ce titre, il traite de la politique québécoise, canadienne et, occasionnellement, américaine. Il tient aussi un carnet sur le site de Radio-Canada.
