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Modèle:Infobox Gène

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Vous êtes sur la page du Modèle Infobox Gène basé sur le Template Infobox Gène (de WP:en). Les données de cette infobox proviennent de Wikidata. Le code Lua de ce modèle est localisé dans le Module:Infobox/Gène.

Utilisation sur l'article d'un gène

(Actuellement inactif) Ajoutez {{infobox Gène}} en haut de la page de l'article sur le gène. L'infobox est alimentée par l'item Wikidata de la page où cette infobox est placée. Pour connaître l'élément Wikidata auquel est liée cette page, cliquez sur le lien "élément Wikidata" dans le menu "Outils" situé sur un des côtés de l'article (variable selon votre habillage).

Utilisation sur une page de protéine

Ajoutez {{infobox Gène}} en haut de la page de la protéine. Cette infobox est remplie en utilisant l'élément wikidata de la protéine pour trouver le gène codant et alors utiliser l'élément wikidata du gène pour remplir l'infobox.

Utilisation sur d'autres pages

Toute page peut afficher l'Infobox même si elle n'a pas de gène ou de liaison interwiki protéique. L'élément Wikidata doit être explicitement ajouté en tant que paramètre et le module sous-jacent est invoqué. Par exemple, appuyer {{#invoke:Infobox_gene|getTemplateData|QID=Q414043}} en haut de n'importe quelle page créera une infobox pour le gène RELN. QID est l'élément de gène Wikidata utilisé pour remplir l'infobox. Remplacez l'ID d'élément Wikidata (QID) d'intérêt comme paramètre QID.

Message d'erreur

"An Error has occurred retrieving Wikidata item for infobox" Indique un élément wikidata non gène / protéine ou un élément incomplet de wikidata

Catégories

L'inclusion de ce modèle entraînera automatiquement l'ajout de catégories pertinentes en fonction des propriétés du gène. Ceux-ci incluent la catégorie: protéines et catégories humaines qui correspondent au chromosome où se trouve le gène, comme la catégorie: Chromosome 3 humain. D'autres catégories ajoutées manuellement à l'article en dehors du modèle fonctionneront comme d'habitude.

Structure des données

Structure de réseau de base du projet wikidata ProteinBoxBot
  • Les articles de Wikipedia sont liés à la page de données des gènes de Wikidata (#Case A) ou page de données protéiques (#Case B) à travers d:Help:Sitelinks. Dans la plupart des cas, les articles sont connectés à la page de données des gènes.
  • Les pages du gène et des protéines sont interconnectées par "encodes (d:P:P688)" et "encoded by (d:P:P702)" réclamations de propriété (flèches horizontales "→", "←" dans la tableaux).
  • Les pages gènes de différentes espèces sont interconnectées par le biais des revendications de propriété "(D: P: P684)" (flèches verticales "↑", "↓" dans le tableau).

Les données que l'infobox gène montre aux lecteurs est collectée à partir de ces pages Wikidata interconnectées.

Case A

In most cases, Wikipedia article page is connected to Human gene data page. For example, Sonic hedgehog.

Wikipedia
(Article)
Wikidata
(Gene)
Wikidata
(Protein)
Human Wikipedia article page
Sonic hedgehog
d:Help:Sitelinks
d:Help:Sitelinks
Human gene data page
SHH (d:Q14860072)
→encodes (d:P:P688)→
←encoded by (d:P:P702)←
Human protein data page
Sonic hedgehog (d:Q2477760)
↑   ↓
ortholog (d:P:P684)
↑   ↓
Mouse Mouse gene data page
Shh (d:Q14860079)
→encodes (d:P:P688)→
←encoded by (d:P:P702)←
Mouse protein data page
Sonic hedgehog (d:Q14860215)
↑   ↓
ortholog (d:P:P684)
↑   ↓

Case B

Dans certains cas, la page de l'article de Wikipedia est liée à la page dédiée à la protéine de l'homme. Par exemple, pour la page Reelin.

Wikidata
(Gene)
Wikidata
(Protein)
Wikipedia
(Article)
Human Human gene data page
RELN (d:Q414043)
→encodes (d:P:P688)→
←encoded by (d:P:P702)←
Human protein data page
Reelin (d:Q13561329)
d:Help:Sitelinks
d:Help:Sitelinks
Wikipedia article page
Reelin
↑   ↓
ortholog (d:P:P684)
↑   ↓
Mouse Mouse gene data page
Reln (d:Q14331135)
→encodes (d:P:P688)→
←encoded by (d:P:P702)←
Mouse protein data page
Reelin (d:Q14331165)
↑   ↓
ortholog (d:P:P684)
↑   ↓

Localisation des données

Les suivants sont la liste des données qui sont utilisées dans ce modèle. Afficher l'exemple de données et l'emplacement des données dans le cas de Sonic hedgehog.

Davantage d’informations Donnée, Wikidata property ...
Donnée Wikidata
property
Donnée exemple Donnée de localisation Autres
Homme
Gène
Page
Homme
Protéine
Page
Souris
Gène
Page
Souris
Protéine
Page
Q14860072 Q2477760 Q14860079 Q14860215

Gene nameLabelraw
AliasesAliasesraw
HGNC gene symbolP353raw
Entrez Gene IDP351raw
ImageP18(image inexistante)
Ensembl Gene IDP594raw
UniProt IDP352raw
EC numberP591raw
OMIM IDP492raw
MGI IDP671raw
HomoloGene IDP593raw
PDB idP638raw
Gene Atlas ImageP692raw
Gene ontologyP680
P681
P682
raw
RefSeq RNA IDP639raw
RefSeq Protein IDP637raw
Ensembl Transcript IDP704raw
ChromosomeP1057linked
Chromosome numberP1813raw
Chromosome lengthP2043raw
Chromosome categoryP910raw
Cytogenetic locationP4196linked
Genomic startP644raw
Genomic endP645raw
Strand orientationP2548raw
Fermer

Liens externes

  • BioGPS, un site permettant la création automatique d'ébauches pour les pages sur les gènes humains utilisant ce modèle en anglais
  • Jon W Huss, Camilo Orozco, James Goodale, Chunlei Wu, Serge Batalov, Tim J Vickers, Faramarz Valafar et Andrew I Su, « A Gene Wiki for Community Annotation of Gene Function », PLoS Biology, vol. 6, no 7, , e175 (PMID 18613750, DOI 10.1371/journal.pbio.0060175)

Utilisation

Description du rôle de ce modèle à compléter.

Exemple

{{Infobox Gène|getTemplateData|QID=Q18031947}}

An Error has occurred retrieving Wikidata item for infobox

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