Le Palais Royal d'Évora trouve son origine dans le couvent et le collège de São Francisco, construits avant le règne du roi Alphonse IV . La première réception royale du couvent a lieu en 1336, lorsque le prince Pedro de Portugal célèbre son mariage avec Constanza Manuel, ce qui attira l'attention royale sur le couvent.
En 1387, le roi Jean Ier entreprend la transformation du couvent en palais en ordonnant la construction de deux chambres, d'une antichambre, d'une auberge, de logements pour les domestiques, d'un puits et d'une orangeraie. Il fait également expulser les franciscains résidents de certaines ailes du couvent devenu palais. Bien qu'il ait transformé le couvent en un palais de taille respectable, il s'agit d'une résidence privée, non royale, réservée à l'usage du roi, de la reine et de leurs enfants.
En 1470, le roi Alphonse V élève le palais de São Francisco, comme on l'appelle alors, au rang de palais royal. Il agrandit le complexe et y installe sa cour, auparavant située au palais d'Estaus. Le roi y séjourne fréquemment, mais après sa défaite lors de la guerre de Succession de Castille, il passa le reste de sa vie dans un monastère près de Sintra.
Le fils du roi Alphonse V, le roi Jean II, est le premier souverain à utiliser le palais comme résidence permanente, et non comme lieu de retraite ou résidence saisonnière, contrairement à ses prédécesseurs. De 1481 à 1482, Jean II installe les Cortes portugaises, son parlement, au palais royal d'Évora. En 1482, afin de mieux accueillir les Cortes, il fait agrandir l'ancien presbytère du couvent pour y installer les bureaux des Hauts Offices de la Cour royale, ce qui permet une meilleure organisation et une plus grande structuration du parlement et, par conséquent, au roi Jean II de résider au palais pendant une longue période. En 1490, Jean II y installe de nouveau les Cortes portugaises et, le 24 mars 1490, le palais devient le théâtre des festivités et de la cérémonie du mariage d'Alphonse, prince de Portugal, avec Isabelle, princesse des Asturies. Pour faciliter les célébrations nuptiales, Jean II fait agrandir le palais par la construction d'une nouvelle aile et de jardins. En 1493, le roi Jean II poursuit les travaux du palais, créant la Salle des Ambassadeurs, la Salle de la Reine, l'Armurerie Royale et le Tribunal du Palais de São Francisco, ce qui relégua les moines du palais dans des espaces plus restreints. En 1495, le pape Alexandre VI accorda au roi Jean II, conformément à sa demande, le droit d'expulser définitivement tous les ecclésiastiques résidant encore dans la partie conventuelle du palais, à condition qu'il leur fasse construire une église et un nouveau couvent.
À la mort du roi Jean II en 1495, son cousin, Manuel Ier, duc de Béja et Viseu, lui succède sous le nom de Manuel Ier du Portugal. Le monopole qu'il détient sur le commerce des épices lui permet de devenir un grand mécène des arts, faisant construire de nombreux palais, couvents et églises à travers le pays. Manuel Ier porte un grand intérêt à Évora, y établissant sa cour à plusieurs reprises. De 1502 à 1520, il ordonne d'importants travaux de rénovation, de construction et d'agrandissement. Durant les campagnes manuélines, nom donné à l'ensemble de ces travaux, le palais devint l'un des plus vastes d'Ibérie. Ces ajouts s'inspiraient de l'Alhambra de Grenade. Sous l'impulsion des architectes Martim Lourenço, Álvaro Anes et António de Lagoa, la campagne manuéline vit la construction de la salle Couto, de l'aile des Infants, d'une infirmerie, des jardins royaux et du terrain de chasse, de la bibliothèque royale et de la galerie des Dames, seule partie du palais subsistant jusqu'à nos jours. Parallèlement à l'agrandissement du palais, le roi Manuel Ier entreprend également la rénovation des parties existantes, notamment la salle de la Reine, les quartiers des domestiques et le Rossio. En 1519, il charge l'architecte André Pires de transformer la sobre salle des Ambassadeurs en une salle du trône manuéline, orientée vers le Rossio.
En 1616, sous l'Union ibérique, Philippe II d'Espagne visite Évora et, à la demande des Franciscains, délivre un diplôme royal intégrant le bâtiment, le potager, le verger et le jardin du couvent. Ce décret marque le début de la destruction de la Chambre de la Reine par la construction de deux chambres pour les frères et la réutilisation des matériaux de maçonnerie et autres matériaux du palais. La majeure partie du complexe est détruite durant la guerre de Restauration portugaise [1].
Depuis 1865, le Palais Manuel sert de musée archéologique, de théâtre et d'espace d'exposition, jusqu'à l'effondrement de sa toiture le 18 février 1881. Après la catastrophe, il est transformé en théâtre public – le Teatro Eborense – suite aux travaux dirigés par l'ingénieur Adriano de Sousa Monteiro, qui modifient les plans d'origine en ajoutant un étage à charpente métallique, conformément au goût de l'époque. En mars 1916, il est ravagé par un incendie et reste en ruines jusqu'en 1943, date à laquelle les Monuments nationaux le récupérent, restaurant le bâtiment et préservant les éléments essentiels de l'ancien pavillon [2].
