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En , il devient président délégué du Racing Club de Strasbourg, alors qu'Egon Gindorf en est encore le président. Ce dernier se retirant, il est le mieux placé pour racheter le club. Cependant, Alain Afflelou désire également reprendre les rênes du club strasbourgeois, contraignant Philippe Ginestet à se retirer.
Au terme d'un long feuilleton, Alain Afflelou est désavoué et échoue. En décembre 2005, Philippe Ginestet devient l'actionnaire principal du Racing Club de Strasbourg et son président. Le club ayant échoué à remonter en Ligue 1 à la fin de la saison 2008-2009, il démissionne et laisse sa place à Léonard Specht.
En , il revient aux commandes du club. Le il démissionne du poste de président et laisse sa place à Julien Fournier, ancien secrétaire général de l'Olympique de Marseille. Il vend aussi ses parts dans le club à la société anglaise «FC Football Capital Limited».