Roger Johan est né à Mortagne-au-Perche, dans le département de l'Orne (diocèse de Sées), ses parents étaient boulangers. Après la scolarité à Alençon, il part étudier au séminaire français de Rome et obtient des doctorats en philosophie en puis en théologie en . Il est ordonné prêtre le et enseigne la philosophie au petit séminaire de Sées. Pendant la Seconde Guerre mondiale, il contribue à cacher des personnes traquées par la Gestapo, au séminaire. Il est choisi le pour devenir évêque d'Agen et reçoit la consécration épiscopale le de la même année des mains de l'archevêque de Rouen, Joseph-Marie Martin.
Il fait partie des pères conciliaires lors des quatre sessions du concile Vatican II dont il est un zélé promoteur des réformes dans son diocèse. À partir de , pour raisons de santé, il est assisté d'un coadjuteur en la personne de Sabin Saint-Gaudens qui lui succède au siège d'Agen à compter du .
