Samšín se trouve à 4,5 km à l'est-nord-est de Pacov, à 13 km au nord-ouest de Pelhřimov, à 39,5 km à l'ouest-nord-ouest de Jihlava à 81 km au sud-est de Prague[2].
La commune est limitée par Lesná et Hořepník au nord, par Bořetice à l'est, par Pošná au sud et par Pacov et Velká Chyška à l'ouest[3].
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