Selja est un nom de lieu notamment porté par :
- Selja, un village de la commune de Tori du comté de Pärnu ;
- Selja (en), un village de la commune de Käina du Comté de Hiiu ;
- Selja (en), un village de la commune de Leisi du Comté de Saare ;
- Emmaste-Selja (appelé Selja avant 2017), un village de la commune de Hiiumaa du comté de Hiiu.