Stefano Caldoro entre au gouvernement Berlusconi le comme secrétaire d'État au ministère de l'Instruction, de l'Université et de la Recherche. Le , il devient vice-ministre avec les mêmes attributions. Enfin, le , il est nommé ministre sans portefeuille chargé de la Mise en œuvre du programme du gouvernement et conserve cette fonction jusqu'à la fin du gouvernement en .