Ses travaux scientifiques ont porté principalement sur la littérature syriaque. Il a notamment édité, en collaboration avec Jean-Baptiste Abbeloos, le Chronicon Ecclesiasticum de Bar-Hebraeus (Louvain, 1872-77, 3 volumes), et ensuite, seul, les Hymnes et sermons d'Éphrem de Nisibe (Louvain, 1882-1902, 4 volumes). Ces éditions paraissent parfois, aujourd'hui, imparfaites matériellement et insuffisamment critiques, mais elles ont constitué, à l'époque, une exploration et un défrichage très utiles d'un champ mal connu. S'y ajoutent d'ailleurs de multiples études, soit en introduction des volumes d'édition, soit dans des revues.
Dans le domaine des études bibliques, il a publié en 1866 une Introductio in Scripturam Sacram, en deux volumes, qui fut rééditée six fois jusqu'en 1901. Il publia aussi des commentaires des livres du Pentateuque; son commentaire de la Genèse, notamment, s'étend sur deux volumes de quelque quatre cents pages (Louvain, 1883-84). Il faut citer également son commentaire de l'Apocalypse en français (Louvain, 1893-94). Sa production, dans ce domaine, est marquée par un caractère traditionaliste, peu novateur, globalement étranger aux approches historico-critiques qui se développaient à l'époque dans l'étude des textes bibliques, même s'il était attentif aux découvertes en assyriologie et égyptologie.
On relève aussi, dans sa production, toute une série d'articles réagissant aux publications d'Ernest Renan, qui ont été rassemblés en un volume en 1963. Sa bibliographie jusqu'en 1905 comprend 158 titres. À sa mort, il travaillait à l'édition d'une version française de la Bible.
Annexes
Bibliographie
Paulin Ladeuze, «Notice sur la vie et les travaux de Mgr Lamy», Annuaire de l'Université catholique de Louvain, 1908, p.131-169.
Louis de La Vallée-Poussin, «Notice sur Thomas Joseph Lamy, membre de l'Académie», Annuaire de l'Académie royale de Belgique, 1914, p.559-567.
John Francis Fenlon, article «Thomas Joseph Lamy», Catholic Encyclopedia, 1913.
Paul Servais, article «Lamy, Thomas Joseph», in François Pouillon (dir.), Dictionnaire des orientalistes de langue française, Paris, IISMM-Karthala, 1908.
