Au décès de Toki Mochikane (土岐持兼), fils ainé de Mochimasu, le fils de Mochikane est choisi pour être le prochain shugo (gouverneur) de la province de Mino. Cependant, Saitō Toshinaga, un shugodai (vice-gouverneur), pousse Shigeyori à être le prochain shugo. À l'époque, Shigeyori est membre du clan Isshiki associé mais est adopté par Mochimasu et lui succède en 1467. C'est l'un des nombreux exemples au cours de la partie médiane de la période Muromachi dans lequel le shugodai usurpe le pouvoir du shugo ; le clan Saito lui-même voit son propre pouvoir usurpé plus tard.
En 1467, Shigeyori combat pour les armées de l'Ouest lors de la guerre d'Ōnin. Il commande un groupe de 8 000 hommes et se bat avec les forces stationnées à Kyoto ; son action protège la vie de Saitō Myōchin, le shugodai d'alors de la province de Mino. Par la suite, le clan Tomishima (富島氏, Tomishima-shi) et le clan Nagae (長江氏, Nagae-shi) se rangent du côté des armées de l'Est et une guerre civile se déclenche à l'intérieur de la province de Mino mais Myōchin est en mesure de les défaire. Parce qu'il y a des craintes que les armées de l'Est soient à même de prendre le contrôle et d'influencer le bakufu, les armées de l'Ouest travaillent pour gagner, organiser et rejoindre les puissants sanctuaires et autres groupes importants. De cette façon, Myōchin est en mesure d'étendre son pouvoir aux provinces d'Owari, d'Ise, d'Ōmi et Hida et Shigeyori d'exercer plus d'influence sur les armées de l'Ouest.