Le club est créé en 1999 afin de concurrencer le Tafea FC, club qui avait remporté toutes les éditions du championnat du Vanuatu depuis la création de cette compétition en 1994.
Aujourd'hui, le Tupuji Imere FC est le seul club à concurrencer le Tafea FC. Il se classe régulièrement sur le podium du championnat. Le club subit toutefois une défaite mémorable de 12-0 contre le Tafea FC.
