L'escadron a été créé le et immédiatement chargé de l'évaluation et des tests du missile anti-rayonnement à grande vitesse AGM-88 HARM, et est devenu le premier escadron pilotant le EA-6B Prowler à se déployer opérationnellement avec le missile HARM lors de son premier déploiement à bord de l'USSJohn F. Kennedy(CV-67) en août 1986 au sein du Carrier Air Wing Three (CVW-3).
EA-6B Prowler du VAQ-140
Puis il rejoint le Carrier Air Wing Seven (CVW-7) en 1988, dont il est toujours actuellement.
En 1999, le VAQ-140 participe à l'Opération Force alliée à l'appui du bombardement de la Yougoslavie par l'OTAN, prenant le commandement de l'Electronic Attack Wing Aviano, composé de 100 membres d'équipage et de 300 membres du personnel de soutien.
En 2002, l'escadron réembarque sur l'USS John F. Kennedy , pour un autre déploiement de combat à la Base militaire d'Al-Udeid au Qatar. En 2004 le VAQ-140 s'est de nouveau déployé à bord de l'USS George Washington pour soutenir la guerre en Irak. En mai 2005, l'escadron s'est déployé au Marine Corps Air Station Iwakuni au Japon.
En 2006, l'escadron a commencé un déploiement prolongé de huit mois avec la moitié de l'escadron opérant à partir de la base aérienne Al-Asad, en Irak, et la moitié de l'escadron opérant à partir de l'USS Dwight D. Eisenhower.
En 2009, à bord de l'USS Dwight D. Eisenhower, l'escadron participe à l'appui de l'Opération Enduring Freedom, ainsi qu'en 2010
Puis le VAQ-140 a effectué deux déploiements à bord de l'USS Dwight. D. Eisenhower en 2012 et 2013 à l'appui de l'Opération Enduring Freedom et des opérations de sécurité maritime dans la zone de responsabilité de la 5ème flotte.
L'escadron a terminé la transition vers l'EA-18G Growler en juillet 2014. L'escadron s'est déployé à bord de l'USSHarry S. Truman(CVN-75) de novembre 2015 à juillet 2016 pour mener une opération de combat en Irak et en Syrie à l'appui de l'Opération Inherent Resolve. D'avril 1919 à janvier 2020 l'escadron s'est déployé à bord de l'USSAbraham Lincoln(CVN-72)pour un déploiement prolongé baptisé "The Endless Bummer" pour apaiser la tension avec l'Iran.